Naslov
Multigenska tipizacija fitoplazmi ribosomske skupine 16SrXII-A
(Multilocus typization of 16SrXII-A ribosomal group phytoplasma)

Autori
Pušić, Petra

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
26.10

Godina
2010

Stranica
66

Mentor
Šeruga Musić, Martina

Ključne riječi
fitoplazme; gen tufB; vmp1 i secY; MLT analiza; PCR; RFLP; sekvenciranje; filogenetska analiza; genska varijabilnost
(genetic variability; MLTs analysis; PCR; phylogenetic analysis; phytoplasma; RFLP; sequencing;; secY; tufB and vmp1 gene)

Sažetak
Fitoplazme su pleomorfni prokarioti iz razreda Mollicutes koji predstavljaju unutarstanične simbionte floema biljaka i hemolimfe kukaca. Nije ih moguće uzgojiti in vitro na hranjivoj podlozi te se njihova detekcija i klasifikacija temelji na polimorfizmu evolucijski očuvane genske regije za 16S rDNA na temelju kojeg ih dijelimo u 15 ribosomskih skupina (16SrI-16SrXV). Žutice vinove loze (grapevine yellows, GY) su gospodarski značajne bolesti uzrokovane fitoplazmama pretežito iz skupina flavescence dorée (16SrV) i stolbur (bois noir, 16SrXII-A). Molekularne analize genske regije 16S rDNA nisu uvijek dovoljne za točnu i preciznu identifikaciju i klasifikaciju izolata ribosomske skupine 16SrXII-A jer pokazuju nisku varijabilnost između njih. Preciznija klasifikacija fitoplazmi ima ključnu ulogu u epidemiologiji i monitoringu fitoplazmoza. Cilj ovog diplomskog rada bio je provesti multigensku tipizaciju izolata fitoplazmi iz ribosomske skupine 16SrXII-A, izoliranih iz zaraženih trsova vinove loze (Vitis vinifera L.) s područja Hrvatske, pomoću PCR/RFLP-analize gena tufB, vmp1 i filogenetske analize gena secY te pritom istražiti gensku varijabilnost dotičnih izolata. Rezultati analize pokazali su postojanje varijabilnost između i unutar izolata ribosomske skupine 16SrXII-A te dokazali vrijednost primjene multigenske tipizacije u diferencijaciji između srodnih sojeva.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA