Naslov
Struktura i organizacija subtelomerne satelitske porodice JMH2 u vrsti Anemone hortensis L. (Ranunculaceae)
(Structure and organization of subtelomeric satellite family JMH2 in Anemone hortensis L. (Ranunculaceae))

Autori
Vilagoš, Bojan

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
18.04

Godina
2008

Stranica
43

Mentor
Besendorfer, Višnja

Neposredni voditelj
Mlinarec, Jelena

Ključne riječi
Anemone; satelitska DNA; subtelomerna ponavljanja; fluorescencijska hibridizacija in situ
(Anemone; satDNA; subtelomeric repeats; fluorescence in situ hybridization)

Sažetak
Genomi biljaka sadrže velike količine uzastopno ponavljajuće (satelitske) i raspršene DNA koje se razlikuju u slijedu nukleotida, položaju na kromosomima i zastupljenosti u genomu. U ovom istraživanju karakterizirana je JMH2 satelitska porodica osnovne jedinice ponavljanja duljine od 743 bp (HindIII fragment) u vrsti Anemone hortensis L. (2n=16), te joj je određena primarna struktura i kromosomska organizacija. Osnovna jedinica ponavljanja JMH2 satelitske porodice sadrži biljna (Arabidopsis) telomerna ponavljanja (T3AG3)5, animanlna telomerna ponavljanja (T2AG3)2 i degenerirane telomerne sljedove ukupne duljine 91bp. Stupanj homologije JMH2 sekvenca unutar Anemone hortensis je 78 do 93%, a utvrđena je i varijabilna regija u području između nukleotida 210 i 290 unutar kojeg se nalazi najdulji neprekinuti slijed telomernih ponavljanja duljine 64bp. Fluorescencijskom hibridizacijom in situ utvđena je kolokalizacija JMH2 satelitske porodice sa subterminalnim heterokromatinskim blokovima smještenim na dužem kraku metafaznih kromosoma 1, 2, 3, 4 i 5. Obzirom na položaj na kromosomima JMH2 porodica pripada skupini subtelomernih uzastopno ponavljajućih DNA porodica. Također je potvrđeno da heteromorfnost submetacentričnog para 4 utvrđena na razini heterokromatina odgovara prisutnosti/odsutnosti subtelomerne JMH2 porodice. Nadalje, JMH2 porodica utvrđena je i u drugim vrstama roda Anemone kao i srodnih rodova Pulsatilla i Hepatica. Filogenetska analiza pokazala je da subtelomerna JMH2 porodica nije dobar molekularni biljeg za istraživanje evolucijskih odnosa vrsta unutar roda Anemone i istraživanih srodnih rodova.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA