Naslov
Struktura i ekspresija gena za Bruton tirozin-kinazu (Btk) iz morske spužve Suberites domuncula
(Structure and expression of genes for protein Btk from marine sponge Suberites domuncula)

Autori
Sladojević, Dujo

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
17.11

Godina
2009

Stranica
50

Mentor
Ćetković, Helena

Neposredni voditelj
Perina, Dragutin

Ključne riječi
Suberites domuncula; Bruton tirozin-kinaza; introni; pristranost upotrebe kodona
(Suberites domuncula; Btk; introns; codon usage bias)

Sažetak
Protein Bruton tirozin-kinaza (Btk) iz porodice Tec tirozin-kinaza je uključen u sazrijevanje B limfocita, diferencijaciju, prijenos signala, te apoptozu. Mutacije u genu za protein Btk dovode do nasljedne imunodeficijencije, agamaglobulinemije vezane za X kromosom. Kao modelni organizam u ovom istraživanju korištena je morska spužva Suberites domuncula koja pripada koljenu Porifera, najstarijim danas živućim životinjama, i stoga je vrlo zanimljiva za istraživanje evolucijski sačuvanih gena/proteina. Metodama umnožavanja DNA lančanom reakcijom polimeraze i određivanja slijeda nukleotida u molekuli DNA utvrđen je nukleotidni slijed gena za Btk iz S. domuncula (BtkSD), te položaj introna. Pozicija i faza introna je uspoređena s pozicijom i fazom introna homolognih gena kod drugih organizama. Od ukupno 16 introna u genu za BtkSD (15 u kodirajućoj i 1 u 5'-nekodirajućoj regiji), 10 introna se nalazi na istom položaju i fazi kao i kod homologa iz čovjeka. Položaj introna očekivano pokazuje veću homologiju s homolozima iz kralježnjaka, nego iz beskralježnjaka. Analizirana je pristranost upotrebe kodona gena za BtkSD koja ukazuje da je ovaj gen relativno nisko eksprimiran u spužvi. Gen za BtkSD je u cilju dobivanja veće količine čistog proteina eksprimiran u sustavu koji uključuje ekspresijski vektor pET15b i E. coli BL21 kao domaćina. Protein BtkSD se ne zadržava u topljivoj fazi, nego odlazi u talog gdje se agregira u obliku inkluzijskih tijela.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA