Pregled bibliografske jedinice broj: 427395
Odvajanje virusne satelitne dsRNA primjenom HPLC
Odvajanje virusne satelitne dsRNA primjenom HPLC // 9. Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem ; Zbornik sažetaka / Besendorfer, Višnja ; Klobučar, Goran I. V. (ur.).
Zagreb, 2006. str. 125-127 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 427395 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Odvajanje virusne satelitne dsRNA primjenom HPLC
(Separation of plant viral satellite dsRNA using HPLC)
Autori
Likić, Saša ; Rusak, Gordana ; Krajačić, Mladen
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
9. Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem ; Zbornik sažetaka
/ Besendorfer, Višnja ; Klobučar, Goran I. V. - Zagreb, 2006, 125-127
ISBN
953-6241-06-4
Skup
9. Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem
Mjesto i datum
Rovinj, Hrvatska, 23.09.2006. - 29.09.2006
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
CMV; satRNA; HPLC; detekcija; purifikacija
(CMV; satRNA; HPLC; detection; purification)
Sažetak
Satelitne RNA molekule su biljni subviralni agensi čija replikacija i širenje ovise o virusu pomagaču. Satelitne RNA molekule koje dolaze s virusom mozaika krastavca mogu izazvati ekonomski značajne štete u poljoprivredi, naročito na rajčici. Replikacijom virusne i satelitne RNA u biljci nastaju dvolančane replikativne RNA forme (dsRNA). Ove stabilne strukture obično se izoliraju iz zaraženog biljnog materijala kromatografijom na stupcu CF-11 celuloze i razdvajaju i identificiraju upotrebom gel elektroforeze. S ciljem odvajanja satelitne dsRNA od virusne, standardnoj smo metodi pridružili odvajanje tekućinskom kromatografijom visoke moći razlučivanja (HPLC). Uzorci su razdvajani na Helix DVB koloni (3x50mm, Varian) uz linearni gradijent 44-80% otapala B tijekom 12 minuta pri temperaturi 30°C i protoku 0.45 ml/min te detekciji na 260nm (A=0.1M TEAA (trietilamonij acetat), 0.1mM EDTA ; B=0.1M TEAA, 0.1mM EDTA, 25% ACN). Na temelju dobivenog kromatograma izolirana je frakcija satelitne dsRNA, a njena prisutnost u izdvojenoj frakciji potvrđena je gel elektroforezom i metodom RT-PCR uz upotrebu para specifičnih početnica. Rezultati pokazuju da je upotrebom HPLC moguće dokazati i jednostavno izolirati satelitnu dsRNA, pri čemu je izbjegnut korak taloženja i elektoforetskog razdvajanja dsRNA. Navedena metoda mogla bi imati preparativnu primjenu za izdvajanje satelitne dsRNA visoke čistoće koja bi se koristila za daljnje analize.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
