Naslov
Molekularna varijabilnost i populacijska struktura hrvatskih izolata virusa tristeza (Citrus tristeza virus)
(Molecular variability and population structure of Croatian Citrus tristeza virus isolates)

Autori
Černi, Silvija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
15.06

Godina
2009

Stranica
117

Mentor
Škorić, Dijana

Ključne riječi
CTV; gen CP; gen p23; genomske varijante; kloniranje; SSCP; filogenetska analiza; populacijska struktura; evolucijska uska grla
(CTV; CP gene; p23 gene; genomic variants; cloning; SSCP; phylogenetic analysis; population structure; genetic bottlenecks)

Sažetak
Virus tristeza (Citrus tristeza virus, CTV) najrazorniji je virusni patogen agruma. U Hrvatskoj, zbog tradicionalnog cijepljenja agruma na CTV-tolerantnu podlogu, inficirana stabla uglavnom ne pokazuju simptome, što je rezultiralo kontinuiranim rasprostranjivanjem virusa. Genetička raznolikost hrvatskih CTV-izolata istražena je metodama SSCP te analizom sekvenci kloniranjem razdvojenih varijanti gena CP i p23. Kod svih amplikona uočen je visok stupanj heterogenosti. Analizirane sekvence svrstale su se u šest, od ukupno sedam, nedavno definiranih filogenetskih skupina. Čak četiri spomenute skupine uključuju sekvence izolata visokog patogenog potencijala, za kakve se vjerovalo da nisu prisutni na području Mediterana. Njihov patogeni potencijal potvrđen je i biološkom karakterizacijom. Utvrđeno je da je za dobivanje pouzdane informacije o strukturi CTV-kvazivrsta potrebno analizirati najmanje 30 klonova. Dokazano je da evolucijska uska grla nastaju kao posljedica rasprostranjivanja virusa cijepljenjem, te da imaju drastičan utjecaj na oblikovanje populacijske strukture uzorka. Istražene su i virusne varijante čija je populacijska zastupljenost niska, ali mogu imati važan utjecaj na oblikovanje simptoma CTV-infekcije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA