Naslov
Računalna analiza mogućih funkcionalnih efekata novih neklasificiranih nukleotidnih promjena gena BRCA1 i BRCA2 pronađenih u zdravih žena u Hrvatskoj
(In Silico Analysis of Potential Functional Effects of Novel BRCA1 and BRCA2 Unclassified Sequence Variants Found in Healthy Women in Croatia)

Autori
Ozretić, Petar ; Levačić Cvok, Mirela ; Musani, Vesna ; Čretnik, Maja ; Levanat, Sonja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Zbornik sažetaka znanstvenog simpozija "50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj" / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja - Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008, 100-100

ISBN
978-953-6690-78-7

Skup
Znanstveni simpozij "50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj"

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 20.11.2008. - 21.11.2008

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Nije recenziran

Ključne riječi
BRCA1&2 ; rak dojke ; polimorfizmi ; mutacije ; Hrvatska
(BRCA1&2 ; breast cancer ; UVs ; in silico ; Croatia)

Sažetak
Geni BRCA1 i BRCA2 su glavni geni odgovorni za nastanak nasljednog oblika raka dojke i jajnika. Nositelji mutacija u tim genima imaju povećani rizik obolijevanja od različitih vrste raka. Polovica do sada pronađenih nukleotidnih promjena gena BRCA1 i BRCA2 su neklasificirane varijante, što znači da je njihov klinički značaj nepoznat ili nepouzdan. To stvara problem kod genetskog savjetovanja u procijeni rizika obolijevanja. Prvi u Hrvatskoj, razvili smo metodu za otkrivanje nasljedne sklonosti raku dojke i jajnika te analizirali sve nukleotidne promjene gena BRCA1 i BRCA2 u 220 zdravih žena u Hrvatskoj. Koristeći računalne metode pokušali smo odrediti neklasificirane varijante koje bi mogle imati štetan učinak na intronsko ili egzonsko prekrajanje mRNA, na strukturu i funkciju proteina te na funkcionalne domene proteina. Upotrebom nekoliko internet-baziranih alata utvrdili smo da dvije pogrešne zamjene aminokiselina i delecija jedne aminokiseline vjerojatno nemaju štetan učinak na strukturu i funkciju BRCA2 proteina. Dvije istovjetne zamjene aminokiselina mogle bi imati učinak na prekrajanje mRNA promjenom egzonskih pojačivača prekrajanja dok jedina intronska promjena nema utjecaja na prekrajanje mRNA. Ni sve druge promjene u egzonima ne dovode do stvaranja novih mjesta prekrajanja. Računalna analiza je brz i jeftin način preliminarnog određivanja kliničkog značaja neke promjene gena kada su potrebni skupi laboratorijski testovi za utvrđivanje funkcionalnog značaja te promjene.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Temeljne medicinske znanosti

POVEZANOST RADA