Naslov
Uloga evolucijski sačuvanog ostatka tirozina u katalitičkom mehanizmu porodice metalopeptidaza M49
(The role of absolutely conserved tyrosine residue in the catalytic mechanism of metallopeptidase family M49)

Autori
Špoljarić, Jasminka ; Salopek-Sondi Branka ; Vukelić, Bojana ; Šimaga, Šumski ; Vujaklija, Dušica ; Makarević, Janja ; Jajčanin Jozić, Nina ; Abramić Marija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj ; 50 Years of Molecular Biology in Croatia / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja - Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008, 49-49

ISBN
978-953-6690-78-7

Skup
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj ; 50 Years of Molecular Biology in Croatia

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 20.11.2008. - 21.11.2008

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
porodica peptidaza M49; dipeptidil-peptidaza III; usmjerena mutageneza; odnos strukture i funkcije proteina
(peptidase family M49; dipeptidyl-peptidase III; site-directed mutagenesis; protein structure-function)

Sažetak
Porodica metalopeptidaza M49 (porodica dipeptidil-peptidaza III) nedavno je prepoznata kao zasebna porodica proteina na temelju značajne sličnosti aminokiselinskih slijedova svojih članova i jedinstvenog strukturnog motiva, HEXXXH, u aktivnom mjestu. Iako fiziološka uloga dipeptidil-peptidaze III (DPP III) još nije potpuno jasna, pretpostavlja se da je povezana s biološkim procesima regulacije boli, stvaranja očne mrene i obrane od oksidacijskog stresa. Unatoč razjašnjenju kristalne strukture ortolognog enzima iz nižeg eukariota, saznanja o katalitičkom mehanizmu ovog tipa proteolitičkih enzima još su uvijek nepotpuna. U svrhu daljnjeg ispitivanja aktivnog mjesta ljudske DPP III, na osnovi bioinformatičkih analiza odabrana su tri ostatka tirozina (Tyr318, Tyr395 i Tyr644) i ispitana je njihova potencijalna uloga u katalizi. U ovom radu prikazujemo rezultate heterologne produkcije i usmjerene mutageneze ljudske DPP III, koji pokazuju funkcionalnu ulogu Tyr318, jedinog potpuno sačuvanog ostatka tirozina u porodici M49. Posljedica zamjene Tyr318 u Phe je smanjenje kcat za dva reda veličine, ali bez utjecaja na afinitet vezanja supstrata ili kompetitivnog hidroksamatnog inhibitora oblikovanog za interakciju sa S1 i S2 podmjestom enzima. Rezultati ukazuju na ulogu Tyr318 u stabilizaciji prijelaznog stanja tijekom katalize.

Izvorni jezik
Engleski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA