Naslov
Vezanje proteina CTCF na H19 ICR u stanicama Cal27
(CTCF protein binding to H19 ICR in Cal27 cells)

Autori
Popović, Doris

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
26.09

Godina
2008

Stranica
57

Mentor
Novak Kujundžić, Renata

Ključne riječi
genomski upis; CTCF; polimorfizam; H19 ICR; ADP-ribozilacija; kromatinska imunoprecipitacija
(genomic imprinting; CTCF; polymorphism; H19 ICR; ADP-ribosylation; chromatin immunoprecipitation)

Sažetak
Protein CTCF (od engl. CCCTC binding factor) ima brojne uloge u regulaciji transkripcije. Ključan je za genomski upis inzulinu sličnog čimbenika rasta 2 (IGF2). Područje H19 ICR (od engl. imprinting control region), između IGF2 i H19, je nemetilirano na majčinom alelu, što omogućava vezanje CTCFa, koji u ADP-riboziliranom obliku sprječava transkripciju IGF2. Metiliranost H19 ICR na očevom alelu onemogućava vezanje CTCFa te je IGF2 ispoljen. Za proučavanje regulacije genomskog upisa IGF2/H19 trebalo je pronaći heterozigotnu staničnu liniju za polimorfizam u CTCF veznom području na H19 ICR. Kromatinskom imunoprecipitacijom sam u stanicama Cal 27 utvrdila bialelno vezanje CTCFa na H19 ICR. Metodom RT-PCR sam pokazala da su i IGF2 i H19 ispoljeni u Cal 27 stanicama. Inhibicija ADP-ribozilacije 3-aminobenzamidom, nije izazvala promjenu u vezanju CTCFa i ispoljavanju IGF2 i H19, što ukazuje na to da osim izolatorske uloge ADP-riboziliranog CTCFa, vezanog na H19 ICR, dodatni mehanizmi reguliraju genomski upis IGF2/H19.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Temeljne medicinske znanosti

POVEZANOST RADA