Naslov
Mutacija pojedinih aminokiselina u zavojnicama H2 i H3 utječe na vezanje tRNA na atipičnu seril- tRNA-sintetazu
(A sinle amino acid change in helices H2 and H3 affects binding of tRNA by atypical seryl-tRNA synthetase)

Autori
Jarić, Jelena ; Bilokapić, Silvija ; Crnković, Ana ; Lesjak, Sonja ; Ban, Nenad ; Weygand-Đurašević, Ivana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Znanstveni simpozij 50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja - Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008, 36-36

ISBN
978-953-6690-78-7

Skup
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 20.11.2008. - 21.11.2008

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
seril-tRNA-sintetaza ; tRNA ; Methanosarcina barkeri ; interakcija tRNA i seril-tRNA-sintetaze
(seryl-tRNA synthetase ; tRNA ; Methanosarcina barkeri ; tRNA:seryl-tRNA synthetase interaction)

Sažetak
Seril-tRNA-sintetaza (SerRS) je aminoacil-tRNA- sintetaza razreda II koja katalizira aktivaciju serina i njegov prijenos na pripadnu tRNASer. Metanogene arheje posjeduju neobičnu SerRS, evolucijski udaljenu od seril-tRNA-sintetaza iz drugih arheja, eukariota i bakterija. Rješenjem kristalne strukture atipične SerRS iz Methanosarcina barkeri (mMbSerRS) uočene su dvije posebnosti seril-tRNA-sintetaza metanogenog tipa: nova N-terminalna tRNA-vezujuća domena i cinkov ion u aktivnom mjestu. U svrhu proučavanja interakcije mMbSerRS i pripadne tRNASer, struktura kompleksa iz bakterija poslužila je za modeliranje vezanja tRNA na mMbSerRS. Prema modelu duga varijabilna ruka tRNA pozicionirana je upravo za interakciju s N-terminalnom domenom mMbSerRS. Kako bi se odredio doprinos pojedinih aminokiselina u N-terminalnoj domeni u vezanju tRNA, proizvedeno je dvanaest mutiranih oblika mMbSerRS. Test aminoaciliranja, nativna elektroforeza i metoda površinske plazmonske rezonancije upotrijebljeni su za istraživanje vezanja tRNA na mMbSerRS divljeg tipa i na njene mutirane oblike. Na temelju dobivenih rezultata zaključujemo da je uzvojnica H2 ključna za vezanje tRNA. Nadalje, pokazali smo da specifični bočni ogranci, smješteni u uzvojnici H3, također utječu na vezanje tRNA. Navedeni rezultati potvrđeni su in vivo testiranjem mutiranih oblika mMbSerRS na sposobnost suprimiranja amber mutacija u E. coli kad su koeksprimirani s genom za pripadnu arhealnu supresorsku tRNA.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA