Pregled bibliografske jedinice broj: 377708
Određivanja unutarsortne varijabilnosti sorte Plavac mali upotrebom retrotranspozona vinove loze Gret1
Određivanja unutarsortne varijabilnosti sorte Plavac mali upotrebom retrotranspozona vinove loze Gret1 // 50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja (ur.).
Zagreb: Institut Ruđer Bošković, 2008. str. 69-69 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 377708 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Određivanja unutarsortne varijabilnosti sorte Plavac mali upotrebom retrotranspozona vinove loze Gret1
(Application of grapevine Gret1 retrotransposon for detecting intravarietal DNA polymorphism of Plavac mali)
Autori
Malenica, Nenad ; Marasović, Mirela ; Šimon, Silvio ; Jelenić, Srećko ; i Pejić, Ivan
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj
/ Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja - Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008, 69-69
ISBN
978-953-6690-78-7
Skup
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj
Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 20.12.2008. - 21.12.2008
Vrsta sudjelovanja
Poster
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
vinova loza; unutarsortna varijabilnost; retrotranspozon
(grapevine; intravarietal pilymorphism; retrotransoson)
Sažetak
Razlikovanje sorti vinove loze prije ere molekularnih markera temeljilo se na ampelografskim metodama. Obzirom na procijene o 10.000 različitih sorti vinove loze, uvođenje molekularnih markera učinilo je identifikaciju sorata bržom i preciznijom. Nakon prvotnih pokušaja s izoenzimima te RFLP i RAPD markerima, mikrosatelitni markeri (SSR), nametnuli su se kao standard. Danas se za identifikaciju pojedine sorte koristi 6 (odnedavno 9) standardnih SSR lokusa. Osim razlikovanja sorti, vrlo je bitno i razlikovanje klonova vinove loze. Iako bi svi klonovi trebali biti genetički identični, u praksi to nije slučaj. SSR markeri se do sad nisu pokazali dovoljno osjetljivima u određivanju DNA polimorfizama između klonova. Iako AFLP metoda daje nešto bolje rezultate od SSR-a, trenutno ne postoji elegantan sistem markera koji bi pouzdano detektirao unutarsortnu varijabilnost na razini DNA. Jedno od potencijalnih rješenja ovog problema leži u metodama IRAP (Inter-Retrotransposon Amplified Polymorphism), REMAP (Retrotransposon-Microsatelite Amplified Polymorphism) i RBIP (Retrotransposon-Based Insertion Polymorphism). Sve se temelje na poznavanju sekvenci retrotranspozona prisutnim u genomu vinove loze. Gret1, prvi opisani retrotranspozon vinove loze, uzročnik je polimorfizma odgovornog za boju kožice bobice. Ovdje prikazujemo preliminarne rezultate IRAP-a, REMAP-a i RBIP-a, korištenjem Gret1 početnica (primer-a) na dvama klonovima Plavca malog: Plavca malog crnog i Plavca malog sivog.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija, Poljoprivreda (agronomija)
POVEZANOST RADA
Projekti:
119-1191196-1201 - Organizacija, funkcija i mehanizmi evolucije biljnog genoma (Besendorfer, Višnja, MZOS ) ( CroRIS)
178-1781844-1925 - Genetička identifikacija i genetska varijabilnost sorti vinove loze i voćaka (Pejić, Ivan, MZOS ) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb,
Agronomski fakultet, Zagreb
