Naslov
Analiza satelitnih DNA u sekvenciranom genomu vrste Tribolium castaneum (Coleoptera)
(Analysis of satellite DNAs in the sequenced genome of Tribolium castaneum (Coleoptera))

Autori
Meštrović, Nevenka ; Pavlek, Martina ; Žižek, Marta ; Plohl Miroslav

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj Zbornik sažetaka / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja - Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008

Skup
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 20.11.2008. - 21.11.2008

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
genom; satelitna DNA
(genome; satellite DNA)

Sažetak
Nedavno je sekvenciran genom kukca, Tribolium castaneum, te je napravljeno prvo kompletiranje sekvenci koje predstavljaju oko 70% genoma. Smatra se da ˝nepoznati” dio genoma uglavnom čine ponavljajuće sekvence DNA koje ne mogu biti sastavljene automatskom analizom. In silico analiza udjela i rasporeda ponavljajućih sljedova DNA u do sada složenom genomu pokazala je da otprilike 30% čine ponavljajuće DNA (Wang et al, Genome Biology 2008, 9:R61), od čega samo 2, 5% otpada na satelitnu DNA. Ovaj rezultat nije u skladu s eksperimentalnim podacima koji pokazuju da (peri)centromerna satelitna DNA s duljinom monomera od 360 pb (360-satDNA) ima vrlo visok udio u genomu od čak 17%. Predstaviti ćemo naše rezultate in silico i eksperimentalnih analiza novootkrivenih satelitnih DNA iz reptig datoteka koje nisu mogle biti složene u genom. Nadalje, prikazati ćemo sveobuhvatnu analizu prije opisane 360-satDNA u sekvenciranom genomu.

Izvorni jezik
Engleski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA