Naslov
Seril-tRNA-sintetaze iz metanogenih arheja i njihovi eubakterijski homolozi
(Seryl-tRNA synthetases from methanogenic archaea and their eubacterial homologs)

Autori
Močibob, Marko ; Ivić, Nives ; Luić, Marija ; Weygand-Đurašević, Ivana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj / Zahradka, Ksenija ; Plohl, Miroslav ; Ambriović-Ristov, Andreja - Zagreb : Institut Ruđer Bošković, 2008, 16-16

ISBN
978-953-6690-78-7

Skup
50 godina molekularne biologije u Hrvatskoj

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 20.11.2008. - 21.11.2008

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Nije recenziran

Ključne riječi
seril-tRNA-sintetaza
(seryl-tRNA synthetase)

Sažetak
Seril-tRNA-sintetaze (SerRS) su enzimi koji kataliziraju vezanje serina na pripadnu tRNA, za potrebe translacije na ribosomu. Eukariotske i većina arhealnih SerRS sekvencom su homologne eubakterijskim srodnicima, strukturno i funkcionalno su im slične, pa su nazvane bakterijskim tipom SerRS. Samo mala skupina metanogenih arheja (Methanococcales) posjeduje divergentni, metanogeni tip SerRS, koje imaju potpuno različitu veznu domenu za tRNA i drukčiju arhitekturu aktivnog mjesta, sa ionom cinka koji sudjeluje u vezanju serina. U genomu nekih eubakterija, koje posjeduju tipične SerRS, detektirani su hipotetski otvoreni okviri čitanja koji kodiraju proteine homologne metanogenom tipu SerRS. Ti homolozi su kraći od metanogenih SerRS, a nedostaje im vezna domena za tRNA. Klonirani su i pročišćeni homolozi iz bakterija Agrobacterium tumefaciens i Bradyrhizobium japonicum. Rekombinantni proteini su, poput metanogenih SerRS, homodimeri i posjeduju cinkov ion. Katalitički su aktivni, ali suprotno očekivanjima preferentno aktiviraju alanin ili glicin umjesto serina. Homolog iz B. japonicum uspješno je kristaliziran, njegova struktura riješena metodom anomalne disperzije rendgenskih zraka na atomima cinka (engl. SAD), a u tijeku je utočnjavanje strukture. Funkcija krnjih homologa trenutno je nepoznata, a budući da ne posjeduju veznu domenu za tRNA i ne aminoaciliraju tRNA, pretpostavlja se da aktiviraju aminokiseline u druge svrhe umjesto biosinteze proteina.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Biologija

POVEZANOST RADA