Naslov
Računalna analiza položaja visokozakrivljenih regija u genomu čovjeka
(Computational analysis of the location of highly curved DNA regions in human genome)

Autori
Kokan, Tina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
07.11

Godina
2007

Stranica
43

Mentor
Vlahoviček, Kristian

Ključne riječi
zakrivljenost molekule DNA; struktura molekule DNA; genom čovjeka
(DNA curvature; DNA structure; human genome)

Sažetak
Molekula DNA nositelj je genetske informacije u živom svijetu. Sekundarna struktura i fizikalno-kemijska svojstva ovisna o slijedu (npr. zakrivljenost i savitljivost) molekule DNA, važni su čimbenici u regulaciji prijepisa informacije i kondenzaciji kromosoma. Svrha ovog rada je, koristeći računalne metode, odrediti odnos između visokozakrivljenih i kodirajućih regija genoma čovjeka i utvrditi u kojoj su mjeri strukturne značajke DNA prisutne unutar kodirajućih regija. Izračunate su vrijednosti Pearsonovog koeficijenta korelacije i vrijednosti parametra lift metode pravila pridruživanja za cjelokupne kromosomske sekvence genoma čovjeka. Rezultati pokazuju izraženu negativnu korelaciju visokozakrivljenih genomskih odsječaka i kodirajućih regija, kao i rjeđe pojavljivanje visokozakrivljenih nukleotida u kodirajućim regijama, nego što je statistički očekivano s obzirom na pokrivenost genoma egzonima.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Računarstvo

POVEZANOST RADA