Naslov
Razvoj računalnih programa za automatsko pronalaženje modula i domena poliketid sintetaza
(Development of computer programs to automatically find modules and domains of polyketide synthases)

Autori
Radulović, Žarko

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prehrambeno-biotehnološki fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
12.05

Godina
2006

Stranica
54

Mentor
Hranueli, Daslav

Ključne riječi
baze podataka EMBL i VCL; PERL i BioPerl; složeni poliketidi; moduli i domene
(EMBL and VCL databases; PERL and BioPerl; complex polyketides; modules and domains)

Sažetak
Jedna od najvećih skupina sekundarnih mikrobnih metabolita su poliketidi, od kojih su mnogi biološki vrlo aktivni spojevi. Biosintetski im put započinje uzastopnom kondenzacijom jednostavnih građevnih jedinica, što dovodi do izgradnje ugljikovih lanaca određenih dužina katalitičkim djelovanjem ponavljajućih ili modularnih poliketid sintetaza (PKS). Vrlo veliki broj genskih nakupina modularnih PKS sustava je do sada kloniran i sekvenciran, no njihove funkcionalnosti i krajnji proizvodi većinom nisu poznati. Sekvenciranje svih tih genskih nakupina ukazuje na mogućnost modeliranja procesa rekombinacije između modularnih sintetaza pomoću računalnog programa. Takav bi računalni program pružao mogućnost predviđanja kemijskih struktura novonastalih supstancija. U ovom radu za potrebe tog programa izrađen je novi računalni program, kojem je svrha analiza i opisivanje nedovoljno poznatih PKS sustava. Izrađeni računalni program popunjava bazu podataka VCL sekvencijama DNA i proteina modula i domena iz prethodno nedovoljno detaljno opisanih PKS sustava.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biotehnologija

Napomena
27/05

POVEZANOST RADA