Naslov
Ispitivanje proteinskih interakcija u kvascu Saccharomyces cerevisiae koristeći metodu in vivo koimunoprecipitacije i niz endogeno obilježenih otvorenih okvira čitanja
(Testing for protein interactions in yeast Saccharomyces cerevisiae using the targeted in vivo co-immunoprecipitation assay and the array of endogenously tagged open reading frames)

Autori
Beneti, Lucija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prehrambeno-biotehnološki fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
06.04

Godina
2006

Stranica
54

Mentor
Zgaga, Zoran

Neposredni voditelj
Štagljar, Igor

Ključne riječi
endogeno obilježeni proteini; Mre11; Sae2 interakcijski partneri
(endogenously tagged proteins; Mre11; Sae2-interacting partners)

Sažetak
Razvijen je novi sistem za detekciju proteinskih interakcija u kvascu. Formirana je zbirka sojeva kvasaca koji eksprimiraju proteine, C-terminalno obilježene različitim epitopima sa svojih endogenih promotora, uključene u DNA replikaciju, rekombinaciju i popravak. "Mamac" protein sadrži V5 i 6xHis, a "plijen" se razlikuje od "mamca" u 3xVSV umjesto 6xHis. U kvaščevoj stanici protein obilježen sa His će formirati fiziološki kompleks sa svojim interakcijskim partnerima pa koristeći koimunoprecipitacijsku metodu možemo izolirati "mamac" i proteine koji s njim asociraju. Sistem je najprije korišen za reprodukciju interakcija opisanih u literaturi, a zatim i za detekciju proteina koji stupaju u interakcije sa Sae2, proteinom za kojeg se prepostavlja da ima ulogu u popravku dvostrukih lomova u DNA. Testiranje je rezultiralo pozitivnom interakcijom Sae2 sa Mre11, katalitičkom podjedinicom MRX kompleksa koji ima značajnu ulogu u procesiranju dvostrukih lomova u toku mejoze i mitoze.

Izvorni jezik
Engleski

Znanstvena područja
Biotehnologija

Napomena
24/06

POVEZANOST RADA