Naslov
Metoda molekulske zamjene za određivanje strukture ljudske dioksigenaze 3-hidriksiantranilne kiseline
(The Molecular Replacement Method in Structure Determination of the Human 3-Hydroxyanthranilic Acid Ddiokygenase)

Autori
Sambolec, Marija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
14.12

Godina
2007

Stranica
60

Mentor
Prugovečki, Biserka ; Matković-Čalogović, Dubravka

Neposredni voditelj
Karlić, Rosa

Ključne riječi
dioksigenaza 3-hidroksiantranilne kiseline; homologija; sravnjenje sljedova; proteinska kristalografija; struktura proteina
(3-hydroxyanthranilic acid dioxygenase; homology; sequence alignments; protein crystallography; protein structure)

Sažetak
Ljudska dioksigenaza 3-hidroksiantranilne kiseline (3HAO_human) je monomerni citosolični protein koji se sastoji od 286 aminokiselinskih ostataka, relativne molekulske mase 32542 Da. Katalizira sintezu kinolinske kiseline (QUIN) iz 3-hidroksiantranilne kiseline u kinureninskom putu kod metabolizma triptofana. Visoki udio 3HAO_human se nalazi u perifernim organima kao što su jetra i bubrezi, a u malim iznosima je također prisutan i u centralnom živčanom sustavu. Sljed proteina 3HAO_human je sravnjen sa sljedovima pronađenih homologa. Trodimenzionalna struktura proteina 3HAO_human (prostorna grupa P1) određena je metodom molekulske zamjene pri rezoluciji 2, 43 Å ; ; ; ; . Za to su korištene dobivene modelne molekule i riješena struktura ljudske dioksigenaze 3-hidroksiantranilne kiseline u prostornoj grupi P212121 (2qnk), te koordinate nativnog proteina, proteina u kompleksu sa platinom i proteina u kompleksu sa paladijem i platinom. Dobiveni modeli strukture proteina su analizirani, a model cijele strukture dobiven prema riješenoj strukturi 2qnk utočnjen je do R-faktora 19, 3% (Rfree 35, 4%).

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA