Naslov
Proučavanje međudjelovanja proteina korištenjem računala
(Study of interactions among proteins by computer)

Autori
Tomić, Sanja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva / - Zagreb, 2007

ISBN
978-953-7178-10-9

Skup
5. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva

Mjesto i datum
Primošten, Hrvatska, 05.10.2007. - 08.10.2007

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Nije recenziran

Ključne riječi
proteini; međudjelovanje; modeliranje
(proteins; intaractions; modelling)

Sažetak
Većina staničnih procesa zasniva se na međudjelovanju proteina. Predmet naših istraživanja su kompleksi Ras proteina s njegovim efektorima Raf i RalGDS1 , te Barnase-Barstar kompleks2. Ras je prisutan u nizu staničnih procesa gdje služi kao molekularna sklopka. Neke njegove mutacije rezultiraju poremećajima u stanicama, pa ne čudi što su mutanti Ras proteina nađeni kod velikog broja tumora. Barnase je izvanstanična ribonukleaza, a Barstar je njezin stanični inhibitor. Njihov kompleks je jedan od najčvršćih proteinskih kompleksa s konstantom disocijacije oko 10-14M. Odredili smo prirodu najznačajnijih interakcija u navedenim kompleksima te utjecaj točkastih mutacija na njihovu stabilnost. Elektrostatske doprinose nastajanju kompleksa izračunali smo korištenjem Poisson-Boltzmann-ovog pristupa konačnih razlika a primjenom Brown-ove dinamike procijenili smo utjecaj mutacija na brzinu kompleksiranja. Izgradili smo QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) modele za predviđanje slobodne energije vezanja. 1. Tomić S., Bertoša B., Wang T., Wade C. R., PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics, 67 (2007), 435-447. 2. Wang T., Tomić S., Gabdouline R. R., Wade C. R., Biophysical J. 87 (2004), 1618-1630.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Fizika

POVEZANOST RADA