Naslov
Uloga elektrostatskih interakcija u sastavljanju RNA virusa
(Role of electrostatic interactions in the assembly of RNA viruses)

Autori
Šiber, Antonio

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva / Antonije Dulčić - Zagreb : Hrvatsko filozofsko društvo, 2007, 29-29

ISBN
978-953-7178-10-9

Skup
5. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva

Mjesto i datum
Primošten, Hrvatska, 05.10.2007. - 08.10.2007

Vrsta sudjelovanja
Pozvano predavanje

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
virus; protein; RNA; elektrostatika; energetika
(virus; protein; RNA; electrostatic; energetics)

Sažetak
Virusi se sastoje od RNA ili DNA molekule zapakirane unutar omotača sačinjenog od proteina [1]. Jednostruka virusna RNA molekula (ss- RNA) ima značajan negativan naboj (1 e po nukleotidu), a proteini omotača ssRNA virusa su tipično pozitivno nabijeni [2]. ssRNA virusi se u povoljnim uvjetima pH i slanosti spontano sastavljaju i stoga ih se može smatrati strukturama koje minimiziraju slobodnu energiju sustava [3]. Preciznost samosastavljanja i nastanak funkcionalnih virusa navođeni su i elektrostatskim interakcijama koje djeluju između virusne ssRNA molekule, proteina, ali i slobodnih iona (soli). Postojanje elektrostatskih interakcija nameće i ograničenja na dužinu RNA molekule koja se može upakirati unutar proteinskog omotača, a da sastavljanje virusa i dalje bude spontano. Elektrostatske interakcije rezultiraju i efektivnim tlakom (oko 0.5 atm) koji djeluje prema unutrašnjosti ssRNA virusa, što je vrlo različito od dsDNA virusa [4, 5]. Količina soli u otopini također bitno utječe na sastavljanje virusa, a u velikim koncentracijama soli (oko 1 M NaCl), termodinamički je povoljnije sastavljanje praznih virusnih omotača (nefunkcionalnih "virusa") [6]. [1] T. S. Baker et al, Microbiol. Mol. Biol. Rev. 63, 862 (1999). [2] V.A. Belyi and M. Muthukumar, Proc. Natl. Acad. Sci. 103, 17174 (2006). [3] R. F. Bruinsma et al Phys. Rev. Lett. 90, 248101 (2003). [4] D. E. Smith et al, Nature (London) 413, 748 (2001). [5] A. Šiber, Phys. Rev. E 73, 061915 (2006). [6] A. Šiber and R. Podgornik, in preparation.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Fizika, Biologija

POVEZANOST RADA