Naslov
Strukturna analiza derivata oleandomicina i interakcija s ribosomom spektroskopijom NMR i molekulskim modeliranjem
(Structural analysis of oleandomycine derivatives and interaction with ribosome by NMR spectroscopy and molecular modelling)

Autori
Tepeš, Predrag

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno - matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
17.07

Godina
2007

Stranica
98

Mentor
Novak, Predrag

Ključne riječi
interakcija; konformacija; makrolidi; molekulsko modeliranje; ribosom; spektroskopija NMR
(conformation; interaction; macrolides; molecular modelling; NMR spectroscopy)

Sažetak
Konformacijska analiza oleandomicina i njegovih derivata u otopini CDCl3 , DMSO-d6 , aceton-d3 i fosfatni/TRIS pufer određena je uz pomoć metoda i tehnika spektroskopije NMR. Analizirane su homonuklearne vicinalne konstante sprega H2, H3 i NOE/ROE kontakti, te su uspoređeni s literaturno dostupnim konformacijskim analizama strukturno sličnih makrolidnih spojeva. Makrociklički laktonski prsten može poprimiti dvije konformacije – „ folded-in“ i „ folded-out“ . Utvrđeno je da su konformacije svh istraživanih spojeva smjese „ folded-in“ i „ folded-out“ konformacijskih familija, sa većim udjelom „ folded-out“ konformera. Također ispitana je temperaturna ovisnost udjela konformacijskih familija, te ovisnost o dielektričnoj konstanti otapala. Konformacije makrociklikog laktonskog prstena potvrđene su i računima molekulskog modeliranja. Desozamin i oleandroza zaprimaju uobiajenu „ Everett-Tyler“ konformaciju stolice. Pokazano je da šećeri imaju više konformacijske slobode oko glikozidne veze od srodnih šećera u strukturno sličnim makrolidima. Istražena je i aktivna konformacija oleandomicinskih spojeva u kompleksu s ribosomom E.Coli pomoću trNOESY i STD NMR tehnika. Nađene su tri regije odgovorne za vezanje: desozamin, C3-C6 i C10-C14 regija.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA