Naslov
Analiza "biblioteke" satelitnih DNA u partenogenetskog oblića Meloidogyne fallax (Karssen, 1996)
(Analysis of satellite DNA "library" in parthenogenetic nematode Meloidogyne fallax (Karssen, 1996))

Autori
Car, Ana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
20.04

Godina
2007

Stranica
47

Mentor
Plohl, Miroslav

Ključne riječi
evolucija; Meloidogyne fallax; biblioteka satelitnih DNA
(evolution; Meloidogyne fallax; satellite DNA library)

Sažetak
Metodom PCR-a i Southern hibridizacijskom analizom pokazano je da su satelitne DNA potporodica 1a, 1b, 1c, 1d i 2a iz vrste Meloidogyne chitwoodi prisutne u srodnoj vrsti M. fallax, ali u malom broju kopija. Ovi rezultati ukazuju na evoluciju satelitnih DNA prema modelu biblioteke koji pretpostavlja da srodne vrste posjeduju istu zbirku satelitnih DNA, različito zastupljenih među srodnim genomima. Nadalje, klonirani su i analizirani PCR produkti nakon umnažanja genomske DNA vrste M. fallax pomoću početnica koje su specifične za potporodicu 1c iz vrste M. chitwoodi. Dobiveni rezultati pokazuju postojanje dijela monomera različitih satelitnih podporodica vrste M. chitwoodi, koji su prisutni u genomu vrste M. fallax na istom odsječku u uzastopnoj miješanoj organizaciji. To ukazuje na složenu orgnizaciju nukleotidnog slijeda u biblioteci satelitnih DNA u obliku organizacije višeg reda. Pretraga baze EST sekvenci cDNA biblioteka parazitskih nematoda otkrila je postojanje značajne sličnosti u nukleotidnom slijedu između tijela "triplet" odsječka i mRNA iz cDNA biblioteke vrste M. chitwoodi. Ovi rezultati sugeriraju transkripcijsku aktivnost satelitnih DNA u vrstama M. chitwoodi i M. fallax.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA