Naslov
Utjecaj duljine palindromskih sekvencijana stabilnost genoma kvasca Saccharomyces cerevisiae
(The influence of the length of palindromic sequences on the stability of yeast Saccharomyces cerevisiae genome)

Autori
Juranić, Vanda

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prehrambeno-biotehnološki fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
21.03

Godina
2006

Stranica
73

Mentor
Zgaga, Zoran

Ključne riječi
genetička nestabilnost; homologna rekombinacija; kvasac; palindromske sekvencije
(genomic instability; homologous recombination; palindromic sequences; yeast)

Sažetak
Palindromske sekvencije posebna su vrsta obrnuto ponovljenih sekvencija kod kojih dva obrnuta ponavljanja nisu odijeljena niti jednimparom baza. Pronađene su u genomima prokariota i eukariota gdje se nalaze u funkcionalno važnim cis djelujućim regijama kao što su promotorske i terminatorske regije te ishodišta replikacije. Međutim, brojna su istraživanja pokazala da su palindromskesekvencije, zbog svoje sposobnosti da stvarajusekundarne strukture, izrazito rekombinogene te su tako klasificirane kao rizični motivi u DNA. Rekombinogenost palindromskih sekvencija direktno je proporcionalna njihovoj duljini, međutim minimalna duljina palindromskih sekvencija koja stimulira rekombinaciju u mitotskim stanicama kvasca S. cerevisiae još nije precizno utvrđena. Stoga je sa tim ciljem u prethodnim istraživanjima provedenim u ovom laboratoriju razvijen eksperimentalni sustav kojimje moguće pratiti utjecaj duljine i položaja palindromskih sekvencija na sabilnost genoma kvasca S. cerevisiae, a koji se temelji na intrakromosomskoj "pop-out" rekombinaciji između dviju ponovljenih regija CYC1. Pokazano je da palindromske sekvencije duge 110 pb znatno stimuliraju, dok one kraće od 40 pb ne stimuliraju rekombinaciju te da jakost stimulacije ovisi o položaju palindromske sekvencije. Kako bi se dobili precizniji podaci o minimalnoj duljini palindromakoja stimulira rekombinaciju, u ovom su radu konstruirana četiri nova soja kvasca te je primijenjena reproducibilnija metoda određivanja stope "pop-out" rekombinacijetemeljena na fluktuacijskoj analizi. Utvrđeno je da se duljina palindromskih sekvencijakoja jošne inducira "pop-out" rekombinaciju nalazi između 50 i 78 pb te da je stimulacija "pop-out" rekombinacije dva do tri puta veća ako se palindromska sekvencija nalazi između dviju ponovljenih regija CYC1 nego kada se palindromska sekvencija približno iste duljine nalazi u lijevoj kopiji regije CYC1.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Biotehnologija

POVEZANOST RADA