Pregled bibliografske jedinice broj: 260654
Fitoplazme iz jablana – nova vrsta ili molekularna varijabilnost unutar vrste 'Candidatus Phytoplasma asteris'?
Fitoplazme iz jablana – nova vrsta ili molekularna varijabilnost unutar vrste 'Candidatus Phytoplasma asteris'? // Zbornik sažetaka 9. hrvatskog biološkog kongresa s međunarodnim sudjelovanjem / Besendorfer, Višnja ; Filipović, Indira (ur.).
Zagreb: Hrvatsko biološko društvo, 2006. str. 120-121. (plenarno, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 260654 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Fitoplazme iz jablana – nova vrsta ili molekularna varijabilnost unutar vrste 'Candidatus Phytoplasma asteris'?
(Phytoplasmas infecting Croatian poplar - a novel taxon or molecular variability within 'Candidatus Phytoplasma asteris' species?)
Autori
Šeruga Musić, Martina ; Novokmet, Mislav ; Botti, Simona ; Škorić, Dijana ; Bertaccini, Assunta
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
Zbornik sažetaka 9. hrvatskog biološkog kongresa s međunarodnim sudjelovanjem
/ Besendorfer, Višnja ; Filipović, Indira - Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2006, 120-121.
Skup
9. hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem
Mjesto i datum
Rovinj, Hrvatska, 23.09.2006. - 29.09.2006
Vrsta sudjelovanja
Plenarno
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
aster yellows; filogenetska analiza; raznolikost; Hrvatska; 16S rDNA
(aster yellows; phylogenetic analysis; diversity; Croatia; 16S rDNA)
Sažetak
Fitoplazme su unutarstanične patogene bakterije bez stanične stijenke koje naseljavaju floem biljaka, a nalazimo ih i u kukcima. Nije ih moguće uzgojiti na umjetnom mediju, stoga je njihova klasifikacija otežana i definirana nizom pravila čija je osnova prvenstveno raznolikost gena za 16S rRNA. Cilj ovog istraživanja bio je utvrditi rasprostranjenost i raznovrsnost fitoplazmi u populaciji jablana (Populus nigra L. ‘ Italica’ ) na širem području grada Zagreba. Ukupne nukleinske kiseline izolirane su iz uzoraka listova prikupljenih sa 34 stabala. Prisutnost ovih patogena dokazivana je umnažanjem fitoplazmatskog gena za 16S rRNA direktnom i ugniježđenom lančanom reakcijom polimerazom uz pomoć univerzalnih i specifičnih početnica, te RFLP-analizom umnoženih fragmenata. U 12 uzoraka detektirane su fitoplazme iz ribosomske skupine 16SrI ('Candidatus Phytoplasma asteris'). Iz tih uzoraka dodatno su umnožene i druge konzervirane genske regije (gen za elongacijski faktor Tu, geni za ribosomske proteine L22 i S3, gen za aminokiselinsku kinazu). RFLP-analiza pokazala je da 10 izolata pripada ribosomskoj podskupini 16SrI-P, ranije opisanoj samo kod jablana sa zagrebačkog područja .Kod preostala 2 izolata uočeni su jedinstveni obrasci u tri dodatno istraživane genske regije uz pojavu mješovitog restrikcijskog obrasca gena za ribosomske proteine kod jednog od izolata. Rezultati ukazuju na molekularnu varijabilnosti unutar analiziranih genskih regija. Zbog detaljnije analize tih dvaju uzoraka, umnoženi fragmenti gena za 16S rRNA su klonirani i sekvencirani. Filogenetske analize te stupanj sličnosti dobivenih sekvenci s referentnim sojevima ukazuju na mogućnost da bi jedna fitoplazma koja zaražava zagrebačke jablane ipak mogla predstavljati zasebnu vrstu. Potrebna su dodatna istraživanja kako bi se potkrijepila ova tvrdnja.
Izvorni jezik
Engleski
Znanstvena područja
Biologija
