Naslov
Detekcija dvaju viroida u vrstama roda Prunus
(Detection of two viroids infecting Prunus species)

Autori
Savić, Bojana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
28.04

Godina
2006

Stranica
38

Mentor
Škorić, Dijana

Ključne riječi
viroidi; PLMVd; HSVd; izolacija RNA; RT-PCR
(viroids; PLMVd; HSVd; RNA extraction; RT-PCR)

Sažetak
Viroidi su najmanji poznati biljni patogeni. To su kovalentno zatvorene kružne RNA-molekule veličine od 249 do 399 nukleotida. Podijeljeni su u dvije porodice – Pospiviroidae i Avsunviroidae. U Hrvatskoj su nedavno prvi puta detektirani viroid latentnog mozaika breskve (Peach latent mosaic viroid, PLMVd) i viroid kržljavosti hmelja (Hop stunt viorid, HSVd) upotrebom hibridizacijskih metoda. Ovaj diplomski rad imao je za cilj potvrditi dobiveni rezultati primjenom metode RT-PCR. Da bi se ostvario taj cilj trebalo je pronaći optimalne uvjete za RT-PCR. Također je trebalo pronaći i pogodnu metodu izolacije viroidnih RNA jer biljna tkiva, a posebice vrste voćaka iz roda Prunus, sadržavaju spojeve koji mogu inhibirati RT-PCR. Od svih testiranih uzoraka jedino je na jednom uzorku nektarine (Prunus persica L. var. Nectarina) potvrđena prisutnost PLMVd-a i HSVd-a. Negativni rezultati na testiranim trešnjama (Prunus avium L.) ne mogu se smatrati konačnima. Na pouzdanost detekcije utjecala su ograničenja primijenjenih metoda izolacije RNA, predugo skladištenja prve skupine testiranih uzoraka, te dio vegetacijske sezone, inače nepogodne za testiranja viroida, u kojem je prikupljena druga skupina uzoraka. Da bi se pouzdano utvrdila prisutnost navedenih viroida u trešnjama, u daljnjem radu trebalo bi testirati, primjenom metode RT-PCR, svježe biljno tkivo prikupljeno u srpnju uz daljnju optimizaciju metode izolacije viroidne RNA.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA