Naslov
Molekularna varijabilnost fitoplazmi ribosomske podskupine 16SrI-P iz jablana
(Molecular variability of 16SrI-P subgroup phytoplasmas infecting Lombardy poplar trees)

Autori
Novokmet, Mislav

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
25.04

Godina
2006

Stranica
40

Mentor
Škorić, Dijana

Neposredni voditelj
Šeruga Musić, Martina

Ključne riječi
fitoplazme; gen za 16S rRNA; jablan; molekularna varijabilnost; PCR; RFLP
(phytoplasmas; 16S rRNA gene; molecular variability; phytoplasmas; PCR; poplar; RFLP)

Sažetak
Fitoplazme su biljni patogeni iz razreda Mollicutes, koji uzrokuju više stotina gospodarski značajnih bolesti širom svijeta. To su prokarioti bez stanične stijenke koje nije moguće kultivirati na umjetnom mediju, što uvelike otežava njihovo istraživanje. Tek je razvojem molekularno-bioloških metoda (Polymerase Chain Reaction- PCR ; Restriction Fragment Lenght Polymorphism- RFLP) omogućena brza i jednostavna identifikacija pojedinih skupina fitoplazmi. Cilj ovog rada bio je utvrditi rasprostranjenost i raznovrsnost fitoplazmi u jablanima na širem području grada Zagreba. Prisutnost ovih patogena rutinski se dokazuje umnažanjem visokokonzerviranog gena za 16S rRNA lančanom reakcijom polimerazom. Za precizniju klasifikaciju provodi se RFLP-analiza umnoženih fragmenata. U 12 od 34 prikupljena uzorka detektirane su fitoplazme iz ribosomske skupine 16SrI (aster yellows) i to s jednolikom rasprostranjenošću u svim dijelovima grada. Kod 12 pozitivnih uzoraka, umnožene su i druge fitoplazmatske konzervirane genske regije (gen za elongacijski faktor Tu ; geni za ribosomske proteine L22 i S3 ; gen za aminokiselinsku kinazu i ribosomski reciklirajući faktor). RFLP-analiza umnoženih fragmenata pokazala je da 10 izolata pripada ribosomskoj podskupini 16SrI-P, ranije opisanoj samo kod zagrebačkih jablana. Kod preostala 2 izolata uočeni su jedinstveni restrikcijski obrasci u tri dodatno istraživane genske regije što ukazuje na postojanje molekularne varijabilnosti u istraživanoj populaciji fitoplazmi. Pojava mješovitog obrasca gena za ribosomske proteine jednog od izolata upućuje na moguću prisutnost različitih populacija fitoplazmatske DNA u jednom uzorku tj. jednoj biljci. Da bi se bolje istražila pronađena razlika u genomima navedenih izolata fitoplazmi, trebalo bi im odrediti primarnu strukturu i provesti filogenetske analize.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA