Naslov
Molekularna evolucija na primjeru obrazaca upotrebe kodona
(Molecular evolution at the level of codon usage)

Autori
Bartoniček, Nenad ; Vitezić, Morana

Izvornik
Biološki Odsjek, PMF Zagreb

Vrsta, podvrsta
Ostale vrste radova, rektorova nagrada

Godina
2004

Ključne riječi
filogenetsko stablo; matrica udaljenosti; molekularna evolucija; Perl; upotreba kodona
(codon usage; distance matrix; molecular evolution; Perl; phylogenetic tree)

Sažetak
Filogenetska istraživanja na molekulskoj razini postala su zbog svoje preciznosti najprikladnija metoda za proučavanje evolucije živih bića, što je neophodno u proširivanju spoznaja o postanku života i specijaciji. Ovaj rad uvodi alternativnu metodu za proučavanje evolucijskih procesa, zasnovanu na razlici u obrascima upotrebe kodona u različitim organizmima. Izradili smo skup računalnih programa za automatizaciju postupka izračuna i usporedbe obrazaca upotrebe kodona u reprezentativnom uzorku od 330 organizama. Na osnovi izračunatih matrica udaljenosti izradili smo niz filogenetskih stabala podijeljenih po carstvima Bacteriae, Plantae, Avertebratae, Vertebratea, Primates, kao i skupno filogenetsko "stablo života". Rezultati, prikazani grafički u obliku filograma i kladograma, pokazuju da razlike u upotrebi kodona mogu poslužiti u modeliranju i rekonstrukciji evolucijskih procesa.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Računarstvo, Biotehnologija

POVEZANOST RADA