Naslov
Korištenje svojstava aminokiselinskih ostataka u predviđanju položaja transmembranskih segmenata integralnih membranskih proteina.
(Use of amino acid attributes in prediction of transmembrane segments in integral membrane proteins)

Autori
Zoranić, Larisa

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, magistarski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zabreb

Datum
02.12

Godina
2004

Stranica
115

Mentor
Juretić, Davor

Ključne riječi
transmembranske uzvojnice; predviđanje sekundarne strukture; mebranski proteini; sklonosne funkcije
(transmembrane helix; secondary structure prediction; membrane proteins; preference functions)

Sažetak
Algoritam SPLIT odabire najbolji model između predviđanja dobijenih korištenjem većeg broja ljestvica svojstava aminokiselinskih ostataka. Odabir najboljeg modela uključuje "Positive-Inside-Rule", motive bazičnih aminokiselina te dodatna pravila uvedena u procesu optimizacije. Objektivna usporedba algoritma s drugim poslužiteljima pokazala je da je SPLIT 4.0 u samom vrhu skupine najboljih prediktora u svijetu, kada se radi o predviđanju sekventnog položaja i transmembranske orijentacije uzvojnica u integralnim membranskim proteinima.

Izvorni jezik
Engleski

Znanstvena područja
Fizika, Biologija

POVEZANOST RADA