Naslov
Utjecaj palindroma na homolognu rekombinaciju i stabilnost kvašćevog genoma
(The influence of palindromes on homologous recombination and stability of the yeast genome)

Autori
Svetec, Ivan-Krešimir

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prehrambeno-biotehnološki

Mjesto
Zagreb

Datum
15.03

Godina
2005

Stranica
81

Mentor
Zgaga, Zoran

Ključne riječi
kvasac; palindromi; rekombinacija
(yeast; palindrome; recombination)

Sažetak
U ovom radu istraživan je utjecaj palindroma (duljine do 114 pb) na homolognu rekombinaciju i mitotičku stabilnost kvaščevog genoma. Na temelju rezultata transformacije zaključeno je da palindromi imaju složeni utjecaj na uspješnost transformacije i usmjeravanje integracije kružnih nereplikativnih plazmida, ali ne utječu na integraciju lineariziranih plazmida. Osim toga, u ovom radu kvasac je uspješno transformiran linearnim fragmentom dvolančane DNA bez slobodnih krajeva. Rezultati eksperimenata "pop-out" rekombinacije pokazali su da minimalna duljna palindroma koji predstavlja opasnost za stabilnost kvaščevog genoma iznosi približno 50 pb. Molekularnom analizom "pop-out" rekombinanata utvrđeno je da se palindromska i nepalindromska insercija češće gube nego zadržavaju u genomu. Međutim, nepalindromska insercija ostala je u genomu u 18 od 60, a palindromska u samo jednom od 80 analiziranih transformanata. Analiza redosljeda nukleotida u kromosomskoj DNA kvasca S.cerevisiae pokazala je da palindroma duljih od 12 pb ima više, a kratkih (4 do 12 pb) manje nego što bi se očekivalo. Međutim, u skladu s eksperimentalnim podacima, duljina najvećeg palindroma iznosi 44 pb.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biotehnologija

POVEZANOST RADA