Naslov
Kvaščev protein Pex21p kao kofaktor seril-tRNA-sintetaze
(Protein Pex21p acts as co-factor of yeast seryl-tRNA synthetase)

Autori
Godinić, Vlatka

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
13.10

Godina
2003

Stranica
106

Mentor
Weygand-Đurašević, Ivana

Neposredni voditelj
Ročak, Sanda

Ključne riječi
aminoacil-tRNA sintetaza; tRNA; proteinske interakcije; sustav dvaju hibrida; translacija proteina
(seryl-tRNA synthetase; peroxin; protein cofactor; yeast two-hybrid)

Sažetak
Seril-tRNA-sintetaza je enzim razreda II aminoacil-tRNA-sintetaza za koji nije poznato interagira li in vivo s ostalim staničnim komponentama. U literaturi je navedeno kopročišćavanje kvaščeve seril-tRNA-sintetaze s IleRS i TyrRS na Bio-Gel A-5M koromatografskim kolonama što je indikacija mogućeg sudjelovanja SerRS u većim multisintetaznim kompleksima. Korištenjem kvaščeve seril-tRNA-sintetaze kao “ mamca” u sustavu dvaju hibrida otkrivena je interakcija serRS i peroksina Pex21p. Plazmid “ mamac” konstruiran je kao fuzija gena SES1 s 3'-krajem LexA upotrebom kvaščevog ekspresijskog vektora pAB151. Usvrhu otkrivanja domena preko kojih interagiraju SerRS i Pex21p načinjeno je nekoliko delecijskih mutanata (106, 260, 380 i 442) sintetaze. Hibridni proteini eksprimirani su u kvaščevom soju L40 koji sadrži kvaščev gen HIS3 i bakterijski gen lacZ pod kontrolom sintetskih promotora s LexA veznim mjestima. Interakcija peroksina Pex21p gotovo u potpunosti je izgubljena nakon delecije pozitivno nabijenog C-terminalnog peptida SerRS koji je karakterističan za sve eukariotske seril-tRNA-sintetaze.Budući da se zna da eukariotske aminoacil-tRNA-sintetaze sudjeluju u kompleksima s drugim sintetazama i nesintetaznim proteinima, ova neobična interakcija pokazatelj je dodatne funkcije peroksina u specifičnosti serilacije. Zaključujemo da Pex21p djeluje kao specifični aktivator SerRS te povećava efikasnost aminoacilacije. U kontekstu interakcije sa SerRS, moguće je da Pex21p djeluje kao šaperon ili kofaktor koji povećava specifičnost prepoznavanja supstrata i/ili efikasnost serilacije od strane SerRS. Zanimljiva je pretpostavka da Pex21p djeluje kao funkcionalni analog Arc1p u stabilizaciji interakcije između SerRS i tRNA. Osim Arc1p, ovo je jedini znani protein koji sam nije enzim, ali povećava efikasnost aminoacilacije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA