Pregled bibliografske jedinice broj: 164536
Molekularni profili Citrus tristeza virusa i Citrus exocortis viroida izoliranih iz hrvatskih agruma
Molekularni profili Citrus tristeza virusa i Citrus exocortis viroida izoliranih iz hrvatskih agruma // Zbornik sažetaka Osmog hrvatskog biološkog kongresa / Besendorfer, Višnja ; Kopjar, Nevenka (ur.).
Zagreb: Hrvatsko biološko društvo, 2003. str. 123-124 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 164536 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Molekularni profili Citrus tristeza virusa i Citrus exocortis viroida izoliranih iz hrvatskih agruma
(Molecular profiles of Citrus tristeza virus and Citrus exocortis viroid infecting Croatian citrus)
Autori
Černi, Silvija ; Škorić, Dijana ; Krajačić, Mladen
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
Zbornik sažetaka Osmog hrvatskog biološkog kongresa
/ Besendorfer, Višnja ; Kopjar, Nevenka - Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2003, 123-124
Skup
Osmi hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem
Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 27.09.2003. - 02.10.2003
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
citrus tristeza virus; citrus exocortis viroid; dsRNA; RT-PCR; RFLP; SSCP
Sažetak
Citrus tristeza Closterovirus (CTV) i Citrus exocortis viroid (CEVd) najznačajniji su RNA-patogeni citrusa. Osim izazivanja sindroma koji nanose velike ekonomske štete u nasadima agruma diljem svijeta, ova dva patogena ujedno predstavljaju zanimljiv laboratorijski model za istraživanje specifičnih interakcija domaćin-patogen na molekularnoj razini. U istraživanju je obrađeno 30-ak uzoraka agruma s područja srednje Dalmacije od kojih velik broj uzorkovanih stabala nije pokazivao nikakve simptome CTV- ili CEVd-infekcije. Izolacija nukleinskih kiselina provedena je bez prethodnog umnožavanja patogena u odgovarajućim bioindikatorima. Poliakrilamidnom gel elektroforezom uspoređeni su profili replikativne forme (dsRNA) Citrus trisreza virusa te je ista dsRNA poslužila kao kalup u RT-PCR reakciji. Upotrebom specifičnog para početnica umnožena je regija kapsidnog proteina (CP) CTV-a. CTV-amplikoni obrađeni su s više restrikcijskih enzima te su uspoređeni njihovi RFLP-profili. S ciljem amplifikacije čitavih viroidnih molekula, izolirana je viroidna RNA te je proveden RT-PCR upotrebom dva specifična para početnica ; jedan za centralnu konzerviranu, te jedan za lijevu terminalnu regiju viroidnog genoma. CTV i CEVd cDNA dodatno su podvrgnute SSCP (single-strand conformation polymorphism) te HMA (heteroduplex mobility assay) analizama. Molekularna karakterizacija navedenih izolata ukazuje na prisutnost više različitih molekularnih profila navedenih patogena u analiziranim uzorcima. Određivanje primarne strukture nukleinskih kiselina trebalo bi potvrditi rezultate obavljenih analiza te u konačnici pomoći objašnjenju složenih mehanizama interakcije domaćin-patogen.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
