Naslov
Molekulska dinamika u vibracijskoj analizi
(Molecular Dynamics in Vibrational Analysis)

Autori
Hrenar, Tomica

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
19.11

Godina
2003

Stranica
172

Mentor
Meić, Zlatko

Ključne riječi
molekulska dinamika; kvantno-kemijski proračuni; vibracijska analiza; IR spektri; PM3; B3LYP
(: Molecular Dynamics; Quantum-Chemical Calculations; Vibrational Analysis; IR Spectra; PM3; B3LYP)

Sažetak
Simulacijom molekulske dinamike sustava moguće je odrediti razna fizikalno-kemijska svojstva sustava, pa tako i izračunati vibracijske infracrvene (IR) spektre. Ti spektri računaju se iz vremenske ovisnosti dipolnog momenta sustava. Nadalje, postupak izračuna uključuje uprosječivanje rezultata dobivenih pojedinim simulacijama molekulske dinamike kod kojih su varirani početni uvjeti sustava. Pri tome se za generiranje početnih uvjeta koriste ravnotežne geometrije sustava i slučajno raspodijeljene početne brzine pridružene pojedinim atomima. Raspodjela brzina ovisi o temperaturi sustava i masama pojedinih atoma. U radu je razrađena metoda izračuna IR spektara putem molekulske dinamike on the fly, uz kvantno-mehaničko polje sila PM3, te primijenjena na modelne sustave molekula benzaldehida, trans-stilbena, salicilidenanilina i 1, 4– [( α E, α ’ E)– distiril]benzena. Pri tome su ispitane prednosti i nedostatci uporabljene metode usporedbom s klasičnom harmonijskom analizom vibracijskih spektara (B3LYP/6-31G*). Dobiveni rezultati pokazuju da se molekulskom dinamikom mogu korektno reproducirati eksperimentalno dobiveni IR spektri molekula te trendovi u pomacima vrpci nastali kao posljedica izotopnih supstitucija

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija

POVEZANOST RADA