Pregled bibliografske jedinice broj: 1269925
Biološka i molekularna karakterizacija izolata virusa pjegavosti i venuća rajčice
Biološka i molekularna karakterizacija izolata virusa pjegavosti i venuća rajčice, 2023., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet Biološki odsjek, Zagreb
CROSBI ID: 1269925 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Biološka i molekularna karakterizacija izolata virusa pjegavosti i venuća rajčice
(Biological and molecular characterization of tomato spotted wilt virus isolates)
Autori
Pul, Patrik
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet Biološki odsjek
Mjesto
Zagreb
Datum
08.05
Godina
2023
Stranica
67
Mentor
Škorić, Dijana
Ključne riječi
TSWV, rajčica, RT-PCR, sekvenciranje
(TSWV, tomato, RT-PCR, sequencing)
Sažetak
Virus pjegavosti i venuća rajčice (Tomato spotted wilt virus, TSWV) identificiran je prvi put 1930. godine u Australiji kao uzročnik bolesti pjegavosti i venuća rajčice (Solanum lycopersicum L.). Tijekom 2021. i 2022. godine su u Hrvatskoj zabilježeni simptomi TSWV-a na kultivarima rajčica koji se reklamiraju kao rezistentni od strane proizvođača sjemena. Cilj ovog rada bio je potvrditi TSWV kao uzročnika infekcije različitih biljaka s terena i odrediti biološke i molekularne karakteristike virusnih izolata. Infekcija TSWV-om potvrđena je kod tri uzorka metodom reverzne transkripcije i lančane reakcije polimerazom (RT-PCR). Filogenetskim analizama amplikona pokazano je da se radi o izolatima virusa koji potječu iz regionalne virusne populacije. Analizom aminokiselinskog slijeda za nestrukturni virusni protein NSm kod jednog izolata pokazano je da se radi o varijanti virusa koja ne sadrži mutacije povezane s probijanjem rezistencije kod rajčice. Biološki test kojim se nastojalo istražiti biološke značajke (krug domaćina, simptomatologija i probijanje rezistencije kod rajčice) izolata TSWV-a nije bio uspješan zbog termolabilnosti virusa i gubitka infektivnosti biljnog materijala uslijed neadekvatnih uvjeta pohrane.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija, Interdisciplinarne biotehničke znanosti
Napomena
U obradi rezultata studentu je pomagala dr. sc. Dorotea Grbin, poslijedoktorand na HRZZ projektu IPS-2020-01-2960.
POVEZANOST RADA
Projekti:
HRZZ-IPS-2020-01-2960 - Visokoprotočno Nanopore-sekvenciranje mikrobnih genoma u rješavanju problema dijagnostike i epidemiologije biljnih patogena (Škorić, Dijana, HRZZ - 2020-01) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb