Naslov
Upotrebljivost gena za ribosomsku RNA i gena koji kodiraju proteine u rekonstrukciji filogenetskih odnosa unutar porodice Elmidae (Coleoptera)
(Phylogenetic utility of ribosomal and protein- coding genes for reconstructing the phylogeny of Elmidae (Coleoptera))

Autori
Tomaš, Tin

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
PMF

Mjesto
Zagreb

Datum
28.09

Godina
2017

Stranica
72

Mentor
Bruvo Mađarić, Branka

Ključne riječi
Elmidae ; Coleoptera ; molekularna filogenetika ; molekularni markeri
(Elmidae ; Coleoptera ; molecular phylogenetics ; molecular markers)

Sažetak
Elmidae (Coleoptera) je porodica vodenih kornjaša koji se često koriste kao bioindikatori u tekućicama, no filogenetski odnosi unutar porodice su dosada slabo istraženi. U ovom radu analizirana je upotrebljivost gena za ribosomsku RNA i odabranih gena koji kodiraju proteine za pouzdanu rekonstrukciju filogenetskih odnosa vrsta, rodova i podporodica unutar porodice Elmidae. Filogenetske analize pokazale su da su geni za COI i 12S rRNA vrlo varijabilni, a gen za 18S rRNA je izuzetno konzerviran te ovi markeri ne daju pouzdane rezultate. Nuklearni geni za 28S rRNA, CAD i Arg daju bolje razlučivanje i podršku za topologiju. Kombiniranjem većeg broja markera postignuti su znatno bolji rezultati, posebice kombinacijom nuklearnih gena. U većini analiza podporodice Elminae i Larainae su međusobno parafiletske, te ovo istraživanje upućuje na potrebu revizije taksonomskog statusa skupina unutar porodice Elmidae.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA