Pretraga

Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 1261015

Genomi školjkaša ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja

Vojvoda Zeljko, Tanja; Šatović, Eva, Plohl, Miroslav
Genomi školjkaša ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja // Book of abstracts of 12th Croatian Biological Congress with International Participation / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb : Croatian Biological Society, 2015 / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan (ur.).
Zagreb: Hrvatsko biološko društvo, 2015. str. 280-281 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

CROSBI ID: 1261015 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Genomi školjkaša ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja
(Bivalve genomes suggest transposition‐driven mobility of satellite DNA repeats)

Autori
Vojvoda Zeljko, Tanja ; Šatović, Eva, Plohl, Miroslav

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
Book of abstracts of 12th Croatian Biological Congress with International Participation / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb : Croatian Biological Society, 2015 / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2015, 280-281

Skup
12. HRVATSKI BIOLOŠKI KONGRES

Mjesto i datum
Sveti Martin na Muri, Hrvatska, 18.09.2015. - 23.09.2015

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
satelitna DNA, transponirajući elementi, okruženja uzastopnih ponavljanja, školjkaši
(satellite DNA, transposable elements, tandem repeat flankings, bivalves)

Sažetak
Satelitna DNA (satDNA) i transponirajući elementi (TE) čine dvije najznačajnije grupe ponovljene DNA u eukariotskim genomima. S obzirom na nedostatak informacija o DNA sekvencama koje okružuju nizove satDNA, naš je cilj bio istražiti sekvence vezane za satelitna ponavljanja koristeći se školjkašima kao modelnim organizmima. Asemblirani genom kamenice Crassostrea gigas (Zhang et al. 2012) pretražen je na sekvence koje okružuju njezinu satDNA Cg170 (Clabby et al. 1996). Također, u tri druge vrste školjkaša (Ruditapes decussatus, R. philippinarum i Donax trunculus) eksperimentalnim pristupom dobivene su sekvence nekoliko ranije opisanih satDNA i njihovih okruženja. Nekoliko fragmenata je nasumično odabrano i detaljno opisano. Dobiveni rezultati pokazuju da se TE‐slične sekvence (naročito DNA transpozoni) nalaze u blizini satDNA te ukazuju da je intenzivno širenje satDNA sekvenci u genomu vjerojatno uzrokovano procesima koji su vezani za transpoziciju. Navedeno promiče satDNA u vrlo dinamične sekvence koje bi mogle predstavljati građevne jedinice genoma na sličan način te usporedivog značaja kao što su to TE. Stoga, iako se tradicionalno smatraju dvjema odvojenim grupama, satDNA i TE se vrlo vjerojatno intimno isprepliću u procesu širenja po genomu, mnogo više nego što se to dosad smatralo.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija



POVEZANOST RADA

Projekti:
IP-2014-09-3183 - Centromerna genomika beskralježnjaka (CENGEN) (Plohl, Miroslav, HRZZ - 2014-09) ( CroRIS)

Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb

Profili:

Avatar Url Tanja Vojvoda Zeljko (autor)

Avatar Url Eva Šatović Vukšić (autor)

Avatar Url Miroslav Plohl (autor)

Citiraj ovu publikaciju:

Vojvoda Zeljko, Tanja; Šatović, Eva, Plohl, Miroslav
Genomi školjkaša ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja // Book of abstracts of 12th Croatian Biological Congress with International Participation / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb : Croatian Biological Society, 2015 / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan (ur.).
Zagreb: Hrvatsko biološko društvo, 2015. str. 280-281 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
Vojvoda Zeljko, T. & Šatović, Eva, Plohl, Miroslav (2015) Genomi školjkaša ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja. U: Klobučar, G., Kopjar, N., Gligora Udovič, M., Lukša, Ž. & Jelić, D. (ur.)Book of abstracts of 12th Croatian Biological Congress with International Participation / Klobučar, Göran ; Kopjar, Nevenka ; Gligora Udovič, Marija ; Lukša, Žaklin ; Jelić, Dušan - Zagreb : Croatian Biological Society, 2015.
@article{article, author = {Vojvoda Zeljko, Tanja}, year = {2015}, pages = {280-281}, keywords = {satelitna DNA, transponiraju\'{c}i elementi, okru\v{z}enja uzastopnih ponavljanja, \v{s}koljka\v{s}i}, title = {Genomi \v{s}koljka\v{s}a ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja}, keyword = {satelitna DNA, transponiraju\'{c}i elementi, okru\v{z}enja uzastopnih ponavljanja, \v{s}koljka\v{s}i}, publisher = {Hrvatsko biolo\v{s}ko dru\v{s}tvo}, publisherplace = {Sveti Martin na Muri, Hrvatska} }
@article{article, author = {Vojvoda Zeljko, Tanja}, year = {2015}, pages = {280-281}, keywords = {satellite DNA, transposable elements, tandem repeat flankings, bivalves}, title = {Bivalve genomes suggest transposition‐driven mobility of satellite DNA repeats}, keyword = {satellite DNA, transposable elements, tandem repeat flankings, bivalves}, publisher = {Hrvatsko biolo\v{s}ko dru\v{s}tvo}, publisherplace = {Sveti Martin na Muri, Hrvatska} }

Podijeli:





Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font
CROSBI koristi kolačiće (cookies) kako bi poboljšao funkcionalnost stranice.