Pregled bibliografske jedinice broj: 1257638
Utjecaj brzine rasta na efikasnost adaptacije sustavom CRISPR-Cas u bakterija Escherichia coli različitih genetičkih pozadina
Utjecaj brzine rasta na efikasnost adaptacije sustavom CRISPR-Cas u bakterija Escherichia coli različitih genetičkih pozadina, 2022., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 1257638 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Utjecaj brzine rasta na efikasnost adaptacije sustavom CRISPR-Cas u bakterija Escherichia coli različitih genetičkih pozadina
(The influence of growth rate on the efficiency of the CRISPR-Cas mediated adaptation in Escherichia coli of different genetic backgrounds)
Autori
Patricija Knechtl
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
25.10
Godina
2022
Stranica
67
Mentor
Ivančić Baće, Ivana
Neposredni voditelj
Mitić, Damjan
Ključne riječi
naivna adaptacija, ugradnja razmaknica, lokus CRISPR, rpoS, crl, E. coli
(naive adaptation, spacer integration, locus CRISPR, rpoS, crl, E. coli)
Sažetak
Sustav CRISPR-Cas sastoji se od lokusa CRISPR koji zajedno s pridruženim genima cas omogućuje adaptivnu imunost mnogim bakterijama i većini arheja protiv stranih genetičkih elemenata. Lokus CRISPR sastoji se od brojnih ponavljajućih sekvenci DNA koje su razdvojene kratkim razmaknicama strane DNA. Naivna adaptacija prva je faza zaštite u kojoj se kratki fragmenti iz stranih organizama ugrađuju u lokus CRISPR kako bi se zaštitila stanica od budućih napada istom stranom DNA. U ovom radu istražen je utjecaj ekspresije gena cas1 i cas2 na brzinu rasta stanica, određena je faza rasta u kojoj dolazi do ugradnje nove razmaknice te je istražena efikasnost adaptacije u tri različita bakterijska soja E. coli koji imaju tri različite genetičke pozadine (BW25113, AB1157 i MG1655). Također, istraženo je kako količine proteina Cas1 i Cas2 utječu na efikasnost naivne adaptacije (ugradnju razmaknice). Na temelju analize dobivenih rezultata može se zaključiti kako se usporeni rast bakterijskih stanica javlja zbog ugradnje razmaknice u lokus CRISPR, u ranoj log fazi rasta, samo u genetičkoj pozadini BW25113. U bakterijskim sojevima koji su rasli sporo došlo je do ekspresije proteina Cas1 i Cas2, dok geni rpoS i crl nemaju ulogu u izgradnji adaptivne imunosti procesom naivne adaptacije.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
POVEZANOST RADA
Projekti:
HRZZ-IP-2016-06-8861 - Cas3 kao kontrolna točka obrane CRISPR-Cas: razjašnjenje njegove regulacije istraživanjem stabilnosti proteina i prepisivanja u bakteriji Escherichia coli (Cas3 status) (Ivančić Baće, Ivana, HRZZ - 2016-06) ( CroRIS)
Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
