Naslov
Regulacija aktivnosti sustava CRISPR-CAS u bakteriji Escherichia coli: uloga četvrtog promotora
(Regulation of CRISPR-CAS activity in Escherichia coli: the role of the fourth promoter)

Autori
Mitić, Damjan ; Ivančić Baće, Ivana

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
ZBORNIK SAŽETAKA 14. HRVATSKOG BIOLOŠKOG KONGRESA s međunarodnim sudjelovanjem (BOOK OF ABSTRACTS OF THE 14th CROATIAN BIOLOGICAL CONGRESS with International Participation) / Caput Mihalić, Katarina ; Mičetić Stanković, Vlatka ; Urlić, Inga ; Mešić, Armin ; Kružić, Petar - Zagreb : Hrvatsko biološko društvo, 2022, 11-12

Skup
14. HRVATSKI BIOLOŠKI KONGRES s međunarodnim sudjelovanjem (14th CROATIAN BIOLOGICAL CONGRESS with International Participation)

Mjesto i datum
Pula, Hrvatska, 12.10.2022. - 16.10.2022

Vrsta sudjelovanja
Predavanje

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
CRISPR-Cas, cas3, anti-cas, E. coli

Sažetak
Adaptivni imunološki sustav CRISPR-Cas štiti mnoge bakterije i većinu arheja od strane DNA. Sustav CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli pripada klasi 1, tipu I-E, a sastoji se od 8 gena cas i dva lokusa CRISPR. Tri promotora kontroliraju ekspresiju svih komponenti sustava CRISPR-Cas (gen cas3, operon casABCDE12 i lokus CRISPR), a četvrti, nazvan anti-Pcas, je divergentno orijentiran i nepoznate je funkcije. Ovaj promotor kodira kratki transkript od 373 nukleotida koji se preklapa sa zadnjih 205 nukleotida gena cas3 i također je pod kontrolom proteina H-NS, kao i ostala tri promotora. Kako se ovaj transkript može smotati u složenu sekundarnu strukturu predloženo je da može potencijalno stupiti u interakciju s proteinom Cas3 kako bi inhibirao njegovu aktivnost, ili se vezati na RNK transkript gena cas3 i time inhibirati njegovu terminaciju transkripcije i/ili translaciju. U ovom radu smo testirali drugu mogućnost i pokazali metodom RT- qPCR kako transkript anti-cas smanjuje količine transkripata gena cas3 ako se eksprimira u suvišku s plazmida, ali ne u mutantu Δhns. Nadalje, u suvišku transkripta anti-cas3 s plazmida, pripremljena adaptacija (ugradnja novih razmaknica iz iste strane DNA) je efikasnija, dok je zaštita bakterija od napada fagima poništena. Iz svega navedenog, može se zaključiti da suvišak transkripta anti-cas utječe na transkripciju gena cas3 što dovodi do smanjene aktivnosti proteina Cas3, vjerojatno uslijed smanjenja njegovih količina u stanici.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA