Pretraga

Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 1243355

ULOGA PROTEINA BPM1 U KONTROLI METILACIJSKIH OBRAZACA GENA KONTROLIRANIH MEHANIZMOM RDDM U VRSTE Arabidopsis thaliana L.

Vuk, Tamara; Markulin, Lucija; Škiljaica, Andreja; Jagić, Mateja; Bauer, Nataša; Leljak-Levanić, Dunja
ULOGA PROTEINA BPM1 U KONTROLI METILACIJSKIH OBRAZACA GENA KONTROLIRANIH MEHANIZMOM RDDM U VRSTE Arabidopsis thaliana L. // 14.Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem: zbornik sažetaka / Caput Mihalić, Katarina ; Mičetić Stanković, Vlatka ; Urlić, Inga ; Mešić, Armin ; Kružić, Petar (ur.).
Zagreb, 2022. str. 169-170 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)

CROSBI ID: 1243355 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
ULOGA PROTEINA BPM1 U KONTROLI METILACIJSKIH OBRAZACA GENA KONTROLIRANIH MEHANIZMOM RDDM U VRSTE Arabidopsis thaliana L.
(ROLE OF BPM1 PROTEIN IN THE CONTROL OF METHYLATION PATTERNS OF RDDM TARGETED GENES IN Arabidopsis thaliana L.)

Autori
Vuk, Tamara ; Markulin, Lucija ; Škiljaica, Andreja ; Jagić, Mateja ; Bauer, Nataša ; Leljak-Levanić, Dunja

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni

Izvornik
14.Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem: zbornik sažetaka / Caput Mihalić, Katarina ; Mičetić Stanković, Vlatka ; Urlić, Inga ; Mešić, Armin ; Kružić, Petar - Zagreb, 2022, 169-170

Skup
14. Hrvatski biološki kongres

Mjesto i datum
Pula, Hrvatska, 12.10.2022. - 16.10.2022

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
BPM1 ; RdDM ; metilacija DNA ; pirosekvenciranje
(BPM1 ; RdDM ; DNA methylation ; pyrosequencing)

Sažetak
Glavna uloga proteina BPM1 u uročnjaku (Arabidopsis thaliana L.) je u kompleksu kulin3- ovisnih E3 ligaza gdje domenom MATH prepoznaje specifične proteinske supstrate usmjeravajući ih u ubikvitinaciju i degradaciju na proteasomu 26S. Metodama ko-imunoprecipitacije i spektrometrije masa utvrđena je interakcija proteina BPM1 s DMS3 i RDM1 komponentama kompleksa DDR uključenog u RNA-posredovanu metilaciju DNA (RdDM). Kompleks DDR regrutira Polimerazu V te sudjeluje u pozicioniranju metilacijskog kompleksa na genom. Navedene interakcije nisu posredovane domenom MATH, ukazujući kako se kroz ovu interakciju proteini DMS3 i RDM1 ne degradiraju. U svrhu razjašnjena uloge proteina BPM1 u RdDM-u, odabrano je pet gena za analizu metilacije bisulfitnim mapiranjem i pirosekvenciranjem. Geni FWA i CML41 korišteni su kao kontrole budući da je njihova regulacija RdDM-om poznata od ranije. Kromatinskom imunoprecipitacijom identificirali smo zajedničke vezne regije proteina BPM1 i DMS3 na genomu linije s nefunkcionalnom proteasomalnom degradacijom, te izdvojili gene AGL14, RKP i FBW2 kao nove mete proteina BPM1 i RdDM-a. Metilacijski obrasci za svako metilacijsko mjesto i metilacijski kontekst, uspoređeni su između divljeg tipa te linije s overekspresijom proteina BPM1 i linije s nefunkcionalnim proteinom DMS3. Rezultati su pokazali značajno više razine metilacije povezane s RdDM-om u biljkama s povišenom ekspresijom proteina BPM1 te gubitak metilacije u RdDM nefukcionalnoj mutanti dms3.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija



POVEZANOST RADA

Projekti:
HRZZ-IP-2016-06-6229 - MATH-BTB proteini kao regulatori transkripcije i RNA posredovane metilacije DNA u biljnom razvitku (PHYTOMETHDEV) (Leljak-Levanić, Dunja, HRZZ - 2016-06) ( CroRIS)

Ustanove:
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb

Profili:

Avatar Url Dunja Leljak-Levanić (autor)

Avatar Url Mateja Jagić (autor)

Avatar Url Nataša Bauer (autor)

Avatar Url Tamara Vuk (autor)

Avatar Url Andreja Škiljaica (autor)

Poveznice na cjeloviti tekst rada:

www.hbd-sbc.hr

Citiraj ovu publikaciju:

Vuk, Tamara; Markulin, Lucija; Škiljaica, Andreja; Jagić, Mateja; Bauer, Nataša; Leljak-Levanić, Dunja
ULOGA PROTEINA BPM1 U KONTROLI METILACIJSKIH OBRAZACA GENA KONTROLIRANIH MEHANIZMOM RDDM U VRSTE Arabidopsis thaliana L. // 14.Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem: zbornik sažetaka / Caput Mihalić, Katarina ; Mičetić Stanković, Vlatka ; Urlić, Inga ; Mešić, Armin ; Kružić, Petar (ur.).
Zagreb, 2022. str. 169-170 (poster, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
Vuk, T., Markulin, L., Škiljaica, A., Jagić, M., Bauer, N. & Leljak-Levanić, D. (2022) ULOGA PROTEINA BPM1 U KONTROLI METILACIJSKIH OBRAZACA GENA KONTROLIRANIH MEHANIZMOM RDDM U VRSTE Arabidopsis thaliana L.. U: Caput Mihalić, K., Mičetić Stanković, V., Urlić, I., Mešić, A. & Kružić, P. (ur.)14.Hrvatski biološki kongres s međunarodnim sudjelovanjem: zbornik sažetaka.
@article{article, author = {Vuk, Tamara and Markulin, Lucija and \v{S}kiljaica, Andreja and Jagi\'{c}, Mateja and Bauer, Nata\v{s}a and Leljak-Levani\'{c}, Dunja}, year = {2022}, pages = {169-170}, keywords = {BPM1, RdDM, metilacija DNA, pirosekvenciranje}, title = {ULOGA PROTEINA BPM1 U KONTROLI METILACIJSKIH OBRAZACA GENA KONTROLIRANIH MEHANIZMOM RDDM U VRSTE Arabidopsis thaliana L.}, keyword = {BPM1, RdDM, metilacija DNA, pirosekvenciranje}, publisherplace = {Pula, Hrvatska} }
@article{article, author = {Vuk, Tamara and Markulin, Lucija and \v{S}kiljaica, Andreja and Jagi\'{c}, Mateja and Bauer, Nata\v{s}a and Leljak-Levani\'{c}, Dunja}, year = {2022}, pages = {169-170}, keywords = {BPM1, RdDM, DNA methylation, pyrosequencing}, title = {ROLE OF BPM1 PROTEIN IN THE CONTROL OF METHYLATION PATTERNS OF RDDM TARGETED GENES IN Arabidopsis thaliana L.}, keyword = {BPM1, RdDM, DNA methylation, pyrosequencing}, publisherplace = {Pula, Hrvatska} }

Podijeli:





Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font
CROSBI koristi kolačiće (cookies) kako bi poboljšao funkcionalnost stranice.