Naslov
Uloga nekodirajuće transkripcije u regulaciji ekspresije gena PHO5 kvasca Saccharomyces cerevisiae
(Role of non coding transcription in regulation of yeast Saccharomyces cerevisiae PHO5 gene expression)

Autori
Ljubas, Jurica

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Prehrambeno-biotehnološki fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
15.07

Godina
2021

Stranica
30

Mentor
Stuparević, Igor

Ključne riječi
antisense RNA, regulacija ekspresije gena, gen PHO5 , NNS kompleks, RNA egzosom
(antisense RNAs, transcriptional regulation, PHO5 gene, NNS complex, RNA exosome)

Sažetak
Antisense RNA su nekodirajuće RNA koje nastaju inicijacijom transkripcije s 3' kraja kodirajućeg lanca gena. Ove su molekule kratkog vremena poluživota, budući da su ubrzo nakon početka transkripcije terminirane NNS kompleksom i degradirane RNA egzosomom. Brojna istraživanja pokazuju da se antisense RNA transkribiraju na velikom broju lokusa i da se njihova uloga povezuje s regulacijom ekspresije pripadajućih gena. Cilj ovog rada bio je istražiti ulogu antisense transkripcije u regulaciji ekspresije gena PHO5 kvasca S. cerevisiae. Sustavom Anchor away postignut je rapamicinom-inducirani eksport RNA-vezujuće podjedinice NNS kompleksa Nrd1 iz jezgre, što je rezultiralo sporijom kinetikom aktivacije transkripcije gena PHO5. Nadalje, korišten je CRISPRi sustav sačinjen od katalički-inaktivne endonukleaze Cas9 (dCas9) i molekule guide RNA, koja navodi dCas9 na specifičnu regiju gena. CRISPRi sustavom ciljano je zaustavljena transkripcija PHO5 antisense RNA, što je rezultiralo bržom kinetikom aktivacije transkripcije gena PHO5. Dobiveni rezultati stoga upućuju na negativan regulatorni utjecaj antisense RNA na kinetiku ekspresije gena PHO5.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biotehnologija

POVEZANOST RADA