Naslov
Ispitivanje inhibitornog učinka derivata futalozina na SARS-CoV-2 3CLpro metodom molekulskog sidrenja
(A molecular docking study of futalosine derivatives as potential SARS-CoV-2 3CLpro inhibitors)

Autori
Nucak, Antonija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Farmaceutsko-biokemijski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
12.07

Godina
2022

Stranica
43

Mentor
Rimac, Hrvoje

Ključne riječi
SARS-CoV-2, COVID-19, 3CLpro, futalozin, molekularno sidrenje
(SARS-CoV-2, COVID-19, 3CLpro, futalosine, molecular docking)

Sažetak
Globalna pandemija COVID-19, koju je uzrokovao patogen SARS-CoV-2, u više od 2 godine odnijela je 6 200 000 života te zarazila pola milijarde ljudi diljem svijeta. Unatoč naporima svjetskih zdravstvenih vlasti, broj umrlih od te bolesti i dalje se svakodnevno bilježi i to u peteroznamenkastim iznosima. U namjeri da se pandemija okonča, znanstvenici se intenzivno bave razvojem učinkovitog antivirusnog lijeka. SARS-CoV-2 3CL proteaza pokazala se privlačnom metom u razvoju prikladnog inhibitora posjedujući sličnosti s dobro istraženim 3CL proteazama drugih koronavirusa. S obzirom na to da igra ključnu ulogu u generiranju nestrukturnih proteina bitnih za virusnu replikaciju, smatra se jednim od najbitnijih enzima odgovornih za virulenciju SARS-CoV-2. U prijašnjim istraživanjima futalozin se istaknuo kao prikladni kandidat za razvoj inhibitora SARS-CoV-2 3CLpro, pokazujući značajan inhibitorni učinak, ali i dobre strukturne i ADMET karakteristike poželjne kod razvoja lijeka. Vodeći se navedenim saznanjima, u ovom istraživanju metodom molekulskog sidrenja ispitivao se inhibitorni učinak ukupno 374 molekula, dizajniranih po uzoru na futalozin te prilagođenih prirodi aminokiselinskih ostataka u aktivnom mjestu enzima. Rezultati istraživanja pokazuju da molekula F41.17 od svih ispitivanih molekula posjeduje najbolji inhibitorni učinak na SARS-CoV-2 3CLpro. Energija vezanja F41.17 iznosi ΔG = -8, 7 kcal mol-1 što je za 1, 3 kcal mol-1 niže u odnosu na energiju vezanja futalozina, a osim što tvori više interakcija s aminokiselinama u aktivnom mjestu enzima, pokazalo se da posjeduje jednake farmakokinetičke značajke kao i futalozin, ako ne i bolje. Sve navedene karakteristike molekule F41.17 čine ju kandidatom vrijednim razmatranja u daljnjem razvoju inhibitora SARS-CoV-2 3CLpro.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Interdisciplinarne prirodne znanosti, Farmacija

POVEZANOST RADA