Pregled bibliografske jedinice broj: 1231289
Računalno potpomognuto određivanje virusnih varijanti i heterogenosti virusne populacije
Računalno potpomognuto određivanje virusnih varijanti i heterogenosti virusne populacije // 2022 45th Jubilee International Convention on Information, Communication and Electronic Technology (MIPRO)
Opatija: Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2022. str. 1757-1761 (predavanje, međunarodna recenzija, cjeloviti rad (in extenso), stručni)
CROSBI ID: 1231289 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Računalno potpomognuto određivanje virusnih
varijanti i heterogenosti virusne populacije
(Computer-aided determination of viral variants and
heterogeneity of the viral population)
Autori
Kopčok, Vedrana ; Kramberger, Tin ; Kramberger, Renata ; Nožica, Bojan
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Radovi u zbornicima skupova, cjeloviti rad (in extenso), stručni
Izvornik
2022 45th Jubilee International Convention on Information, Communication and Electronic Technology (MIPRO)
/ - Opatija : Institute of Electrical and Electronics Engineers (IEEE), 2022, 1757-1761
Skup
45th International Convention on Information and Communication Technology, Electronics and Microelectronics (MIPRO 2022)
Mjesto i datum
Opatija, Hrvatska, 23.05.2022. - 27.05.2022
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Međunarodna recenzija
Ključne riječi
Obrada podataka, Pročišćavanje podataka, Virusi, Shannonova entropija, Nukleotidna raznolikost
(Data processing, Data purification, Viruses, Shannon entropy, Nucleotide diversity)
Sažetak
Obrada velikih skupova bioloških podataka izuzetno je kompleksna zbog problema povezivanja biologije i računarstva kao dva odvojena polja istraživanja. Ovaj rad bavi se obradom podataka i otkrivanjem varijanti unutar populacije mikroorganizama virusa. Koriste se unaprijed pripremljeni skupovi podataka dobiveni sekvenciranjem genoma nad kojima se vrši pročišćavanje i obrada podataka kako bi se naposljetku izračunala Shannonova entropija i Nukleotidna raznolikost. Rezultati obrade podataka i izračuni Shannonove entropije i Nukleotidne raznolikosti su grafički vizualizirani kako bi se odredila heterogenost virusne populacije. Heterogenost virusne populacije pobliže naznačava mogućnost stabilnih mutacija virusa, što može utjecati na učinkovitost postojećih cjepiva. Rad pojašnjava kako je moguće iz velikog i ljudima nepreglednog skupa podataka dobiti vrijedne informacije o mutacijama unutar populacije virusa. Pomoću tehnike objašnjene u radu moguće je obraditi bilo koji skup podataka i izvući zaključke prilikom istraživanja virusa.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Računarstvo
POVEZANOST RADA
Ustanove:
Tehničko veleučilište u Zagrebu
