Pregled bibliografske jedinice broj: 1221651
Genomski signali pozitivne selekcije identificirani kod Pastirskih pasa
Genomski signali pozitivne selekcije identificirani kod Pastirskih pasa // Knjiga sažetaka Dani doktorata biotehničkog područja 2022
Zagreb, Hrvatska, 2022. str. 10-11 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, znanstveni)
CROSBI ID: 1221651 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Genomski signali pozitivne selekcije identificirani
kod Pastirskih pasa
(Genome-wide signals of positive selection identified
in Livestock Guardian Dogs)
Autori
Shihabi, Mario ; Glavaš, Vjeran ; Cubric-Curik, Vlatka ; Zorc, Minja ; Dovc, Peter ; Curik, Ino
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, znanstveni
Izvornik
Knjiga sažetaka Dani doktorata biotehničkog područja 2022
/ - , 2022, 10-11
Skup
Dani doktorata biotehničkog područja
Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 28.09.2022. - 29.09.2022
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
pastirski psi, prilagodba okolišu, sinergijska bihevioralna interakcija. signali selekcije
(Livestock Guardian Dogs, environmental adaptation, synergistic behavioural interaction, selection signals)
Sažetak
Pastirski psi (Canis familiaris) veliki su psi prilagođeni surovim planinskim okruženjima te specijalizirani za zaštitu stoke na ispaši od velikih grabežljivaca u sustavima slobodne ispaše. U isto vrijeme, dugoročni proces umjetne selekcije oblikovao je njihovo ponašanje prema inteligenciji, pouzdanosti, pažljivosti i zaštitništvu. Stoga, kako bismo poboljšali naše razumijevanje mehanizama prilagodbe okolišu i odgovora na umjetnu selekciju kod pastirskih pasa, signali pozitivne selekcije identificirani su u meta-populaciji koju predstavlja devet pastirskih pasmina (116 jedinki) na temelju informacija iz 104 618 SNP genotipova. Primijenjena su dva klasična unutar populacijska pristupa, od kojih ekstremno frekventni homozigotni nizovi (eROHi) mogu detektirati gotovo i potpuno fiksirane selektivne mahove, dok je integrirana ocjena haplotipa (iHS) pouzdanija u otkrivanju slabijih mahova. Identificirano je 28 genomskih regija (11 korištenjem eROHi pristupa i 17 korištenjem iHS pristupa) koje pokazuju visoko značajne signale pozitivne selekcije. Neki od najizraženijih selekcijskih signala povezani su s genima kao što su LRIG3, TRIP11, CNTNAP2 i EFNA5. Predstavljeni rezultati pridonijet će razumijevanju sinergijske bihevioralne interakcije pastirskih pasa s ljudima i pašnim životinjama, posebice ovcama i kozama, te prilagodbi sisavaca na surove planinske uvjete, kao i upravljanju njihovim uzgojem.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija, Poljoprivreda (agronomija), Interdisciplinarne biotehničke znanosti
POVEZANOST RADA
Projekti:
IP-2018-01-8708 - Primjena NGS metoda u procjeni genomske varijabilnosti preživača (ANAGRAMS) (Čubrić Čurik, Vlatka, HRZZ - 2018-01) ( CroRIS)
Ustanove:
Agronomski fakultet, Zagreb
