Naslov
Analiza PI3P-vežućih proteina s FYVE domenom u transkriptomu i proteomu trombocita
(Analysis of PI3P-binding proteins with FYVE domain in platelet transcriptome and proteome)

Autori
Laura Barešić

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Odjel za biotehnologiju

Mjesto
Rijeka

Datum
23.09

Godina
2022

Stranica
53

Mentor
Antonija Jurak Begonja

Neposredni voditelj
Antonija Jurak Begonja

Ključne riječi
PI3P-vežući proteini s FYVE domenom, transkriptom, proteom, trombociti, megakariociti
(PI3P-binding proteins with FYVE domain, transcriptome, proteome, platelets, megakaryocytes)

Sažetak
Stanje uravnoteženog proteoma – proteostaza, ključno je za sve fiziološke procese u organizmu, te je razina pojedinih proteina određena brzinom njihove sinteze, kao i razgradnje te dostupnosti i razine transkripata. Jedna od važnih obitelji fosfolipida u staničnim membranama koji stupaju u interakciju s proteinima je obitelj fosfoinozitida. Svaki odjeljak membrane sadrži neke od karakterističnih fosfoinozitida (ukupno 7 različitih): fosfatidilinozitol-3-monofosfat (PI3P), fosfatidilinozitol-4-monofosfat (PI4P), fosfatidilinozitol-5-monofosfat (PI5P), fosfatidilinozitol-3, 4-difosfat [PI(3, 4)P2], fosfatidilinozitol-3, 5-difosfat [PI(3, 5)P2], fosfatidilinozitol-4, 5-difosfat [PI(4, 5)P2] i fosfatidilinozitol-3, 4, 5-trifosfat [PI(3, 4, 5)P3]. PI3P čini otprilike 15% ukupnih fosfoinozitida u ljudskim stanicama, shodno tome, ovdje se daje detaljna analiza funkcije PI3P, specifične FYVE domene koju veže te proteine koji sadrže FYVE domenu. Osim FYVE domene, PI3P veže i Phox te plekstrin homolognu domenu. U ovom radu analizirani su dostupni podaci transkriptoma i proteoma ljudskih i mišjih trombocita na prisustvo proteina s FYVE domenom te je napravljena usporedba između trombocita ovih dviju vrsta. Korištenjem dostupnih baza DepMap i Međunarodnog konzorcija za fenotipizaciju miševa analizirana je uspješnost stvaranja staničnih linija s delecijom za proteine s FYVE domenom koji su visoko eksprimirani u ljudskom i mišjem proteomu kao i posljedice nedostatka odabranih gena u miševa na njihovu letalnost, i/ili hematološki fenotip. Nadalje, dan je pregled mehanizma kojim PI3P regulira nastanak i funkciju trombocita, ali i općenito kako disfunkcija stvaranja PI3P utječe na različite procese u stanici ili u organizmu.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Temeljne medicinske znanosti, Biotehnologija u biomedicini (prirodno područje, biomedicina i zdravstvo, biotehničko područje)

POVEZANOST RADA