Naslov
Analiza metilacije promotorske regije gena BACH2 kod infekcije virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1
(Analysis of BACH2 gene promotor region methylation in infection with Human immunodeficiency virus type 1)

Autori
Slana, Anita

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Mjesto
Zagreb

Datum
22.05

Godina
2017

Stranica
42

Mentor
Korać, Petra ; Židovec Lepej, Snježana

Ključne riječi
HIV, metilacija DNA, gen BACH2
(HIV, DNA methylation, BACH2 gene)

Sažetak
Zaraza virusom ljudske imunodeficijencije tipa 1 (HIV, eng. Human immunodeficiency virus type 1) povezuje se s progresivnim slabljenjem imunološkog sustava koje, ukoliko se ne liječi, uzrokuje smrt. Stanice podložne zarazi su limfociti CD4+. Tijekom infekcije dolazi do smanjenja njihovog broja u krvi HIV-pozitivnih osoba. Kao oblik liječenja HIV-pozitivnih pacijenata razvijena je antiretrovirusna terapija (ART) koja kombinira razne inhibitore virusnih proteina i dovodi do potpune supresije detektabilne viremije u pacijenata. Gen BACH2 je transkripcijski faktor koji ima ulogu u održavanju homeostaze perifernih naivnih T-limfocita, stvaranju efektorskih memorijskih T-stanica i regulaciji CD4+ senescencije. Cilj ovog istraživanja bio je analizirati razinu metilacije promotorske regije gena BACH2 kod HIV-om zaraženih osoba u odnosu na zdravu populaciju te utvrditi postoje li razlike u razini metilacije njegovog promotora koje ovise o statusu ispitanika. Ispitanici su podijeljeni u dvije skupine. Prvu skupinu činili su HIV-pozitivni pacijenti kod kojih se standardnim testovima ne može detektirati prisutnost virusnih kopija. Drugu skupinu činili su HIV-pozitivni pacijenti kod kojih je viremiju moguće detektirati te, u trenutku prikupljanja uzoraka krvi, nisu primali antiretrovirusnu terapiju. Metodom bisulfitne konverzije DNA i pirosekvenciranja odabranih regija promotora gena BACH2 određen je stupanj metilacije toga promotora. Utvrđeno je da kod obje skupine ispitanika dolazi do povećanja metilacije svih fragmenata promotorske regije u odnosu na kontrolnu zdravu skupinu što upućuje na to da hipermetilacija gena BACH2 dovodi do njegovog utišavanja koje ima ulogu u povećanju broja efektorskih T-stanica potrebnih za imunološki odgovor na zaražene stanice. Povećana metilacija CpG-otoka kod aviremičnih ispitanika može značiti trajnu promjenu u diferencijaciji T-stanica i homeostazi cijelog imunološkog sustava.

Izvorni jezik
Hrvatski

POVEZANOST RADA