Pregled bibliografske jedinice broj: 1182871
Konjugati cijaninske boje i gvanidinijkarbonil - pirola kao nove fluorescentne i CD probe za razlikovanje različitih sekundarnih struktura dvolančane DNA ili dvolančane RNA
Konjugati cijaninske boje i gvanidinijkarbonil - pirola kao nove fluorescentne i CD probe za razlikovanje različitih sekundarnih struktura dvolančane DNA ili dvolančane RNA, 2019., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Kemijski odsjek, Zagreb
CROSBI ID: 1182871 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Konjugati cijaninske boje i gvanidinijkarbonil -
pirola kao nove fluorescentne i CD probe za
razlikovanje različitih sekundarnih struktura
dvolančane DNA ili dvolančane RNA
(The conjugates of cyanine dye and
guanidiniocarbonyl-pyrrole as a fluorescent and CD
probes for distinguishing between various double
stranded DNA or double stranded RNA secondary
structures)
Autori
Košćak, Marta
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet, Kemijski odsjek
Mjesto
Zagreb
Datum
06.09
Godina
2019
Stranica
73
Mentor
Piantanida, Ivo ; Juranović Cindrić, Iva
Ključne riječi
cijanin ; cirkularni dikroizam ; fluorescencija ; gvanidinijkarbonil-pirol ; prepoznavanje dvolančane DNA ili RNA
(cyanine ; circular dichroism ; fluorescence ; guanidiniocarbonyl-pyrrole ; double stranded DNA/RNA sensing)
Sažetak
U sklopu rada okarakterizirana su dva nova konstitucijska izomera gvanidinijkarbonil-pirola (GCP) i 6-bromo-tiazol oranž (cijanin), koji se razlikuju u svojoj povezanosti: kod jednog konjugata GCP je s cijaninom vezan preko atoma dušika u benzotiazolu, a drugi konjugat je povezan preko dušika u kinolinu. Spojevi pokazuju različita svojstva u vodenom mediju, kao i različitost u prepoznavanju raznih dvolančanih DNA i dvolančanih RNA. Specifična karakteristika cijanina je povećana sklonost agregiranja u vodenom mediju. Oba spoja se efikasno vežu na dvolančane DNA i RNA s mikromolarnim afinitetom, s tim da je benzotiazolni izomer pokazao izrazitu fluorescentnu selektivnost prema dvolančanoj RNA, u usporedbi s ostalim ispitivanim dvolančanim DNA uzvojnicama, dok je kinolinski analog pokazao slabu fluorescencijsku selektivnost prema dvolančanoj GC-DNA. Vezanjem na DNA ili RNA, samo je izomer povezan preko kinolina pokazao, po vezanju na DNA/RNA, pojavu induciranog cirkularnog dikroizma (ICD ; λ=450-550 nm), s tim da je pomoću ICD vrpci moguće pouzdano razlikovati A-T(U) polinukleotide od G-C polinukleotida.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija
POVEZANOST RADA
Projekti:
HRZZ-IP-2018-01-5475 - Višekromoforne probe za prepoznavanje pojedinih struktura DNA, RNA i proteina (BioMultiChromoProbes) (Piantanida, Ivo, HRZZ - 2018-01) ( CroRIS)
Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb,
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb