Naslov
Struktura genoma najznačajnijih vrsta riba u mediteranskoj akvakulturi
(Genome structure of the most important fish species in mediterranean aquaculture)

Autori
Šiljić, Marija

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, preddiplomski

Fakultet
Sveučilišni odjel za studije mora

Mjesto
Split

Datum
24.09

Godina
2020

Stranica
30

Mentor
Trumbić, Željka

Ključne riječi
Sparus aurata, Dicentrarchus labrax, dvospolnost, halotolerancija, genom, diferencijacija
(Sparus aurata, Dicentrarchus labrax, hermaphroditism, halotolerance, genome, differentiation)

Sažetak
U ovom završnom radu predstavljene su biološke i ekološke karakteristike dviju najznačajnijih vrsta u mediteranskoj akvakulturi za koje je dostupan kvalitetan nacrt genoma, komarče Sparus aurata (Linnaeus, 1758) i lubina Dicentrarchus labrax (Linnaeus, 1758). Komarča je protandrični dvospolac što je čini zanimljivim modelom za istraživanje hermafroditizma i razvoja spolno- pristranih (SB) gena čija diferencijalna ekspresija dovodi do razvoja spolnog dimorfizma. Genom komarče se sastoji od >760 Mbp i 24 kromosoma u haploidnom setu. Uočeno je da se SB geni komarče ponašaju drugačije nego kod gonohorističnih vrsta. Jedino vrlo konzervirani ženski SB geni sa snažnom razlikom u ekspresiji brže evoluiraju od ostalih gena. Navedena činjenica se potencijalno dovodi u vezu sa smanjenom efektivnom veličinom populacije ženki i smanjenom purificirajućom selekcijom. Kod lubina je posebno zanimljiva njegova eurihalinost te je u genomu identificirano nekoliko genskih obitelji s ulogom u osmoregulaciji i membrasnkom transportu (klaudini, akvaporini, prolaktini). Genom lubina je veličinom nešto manji od genoma komarče i također ima 24 kromosoma. Analizom nukleotidne raznolikosti na razini čitavog genoma su uočeni zanimljivi heterogeni obrasci diferencijacije i smanjene rekombinacije za koje se smatra da su rezultat erozije divergencije i nejednolike introgresije uslijed sekundarnog kontakta nakon dugog perioda alopatrijske izolacije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Biotehnologija

POVEZANOST RADA