Naslov
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca
(Identification of positive selection signatures in the genome of Croatian sheep)

Autori
Shihabi, Mario

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Agronomski fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
12.07

Godina
2021

Stranica
48

Mentor
Čurik, Ino

Ključne riječi
Hrvatske autohtone pasmine ovaca ; Signali pozitivne selekcije ; Kandidat geni ; Autosomi ; Spolni kromosom X
(Croatian autochthonous sheep breeds ; Positive selection signatures ; Candidate genes ; Autosomes ; Sex chromosome X)

Sažetak
Ovčarstvo je jedan od najvažnijih stočarskih sektora u mediteranskom području Hrvatske odakle potječe većina hrvatskih autohtonih pasmina. Prisutni signali pozitivne selekcije posljedica su adaptacije na oskudne okolišne čimbenike, ali i odabira (selekcije) ljudi. U ovom istraživanju je uz autosome bio uključen i spolni kromosom X (kod ženskih jedinki), zbog utjecaja spolno vezanog nasljeđivanja na ekonomski i evolucijski važna svojstva. Cilj rada bio je identificirati signale pozitivne selekcije putem dvije metode, iHS i eROHi, koristeći uzorak veličine 102 jedinke iz 4 autohtone pasmine ovaca Hrvatske i 606 006 SNP-ova (Infinium® HD SNP BeadChip), na kojem je prije analize obavljena kontrola kvalitete. Obje metode temelje se na analizi genomskih varijacija unutar jedne velike metapopulacije, koja ovdje predstavlja hrvatske autohtone pasmine ovaca. Uočeni su mnogi ekonomski i evolucijski važni geni te je tako razjašnjena prisutnost pojedinih signala u populaciji. Za precizniju i pouzdaniju analizu potrebno je povećati uzorak te uključiti još metoda identifikacije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Poljoprivreda (agronomija), Interdisciplinarne biotehničke znanosti

POVEZANOST RADA