Naslov
Multigenska tipizacija izolata bakterija Burkholderia cepacia kompleksa Martina Drmić
(Multilocus sequence typing of Burkholderia cepacia complex isolates)

Autori
Drmić, Martina

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
17.09

Godina
2021

Stranica
38

Mentor
Šeruga Musić, Martina

Ključne riječi
Burkholderia cepacia kompleks, identifikacija, genotipizacija, 16S rRNA, blaTEM, filogenetska analiza
(Burkholderia cepacia complex, identification, genotyping, 16S rRNA, blaTEM, phylogenetic analysis)

Sažetak
Burkholderia cepacia kompleks skupina je Gram- negativnih nefermentirajućih bakterija koju čine 24 usko povezane vrste poznate kao autohtone bakterije u prirodnom okolišu, ali i kao uzročnici infekcija u imunokompromitiranih bolesnika. Budući da u Hrvatskoj do sada nema podataka o vrstama ovog kompleksa, cilj ovog diplomskog rada jest metodom molekularne identifikacije i multigenske tipizacije okarakterizirati sedam prethodno prikupljenih okolišnih izolata te jedan klinički izolat bakterija Burkholderia cepacia kompleksa kako bih ukazala na važnost poznavanja ovih vrsta koje se u okolišu brzo šire pod utjecajem odlaganja ljudskog i životinjskog otpada. Analizom sam obuhvatila gene za 16S rRNA, lepA, atpD, gyrB, gltB, phaC, recA i trpB. Prethodnu identifikaciju izolata kao potencijalnih Burkholderia sp. potvrdila sam molekularnom identifikacijom i filogenetskom analizom gena za 16S rRNA, a multigenskom tipizacijom odredila sam profile genotipova svih izolata. Rezultati analize pokazali su da se radi o vrstama B. multivorans, B. cenocepacia i B. ambifaria, a zabilježena je i pojava novih alela (genotipova) i profila ST (sequence type) ovih vrsta. Vrste Burkholderia cepacia kompleksa često su rezistentne na mnoge antibiotike stoga sam dokazala i mogući mehanizam rezistencije ovih izolata analizom fragmenta gena blaTEM koji kodiraju ß- laktamaze. Rana identifikacija vrsta ovog kompleksa iznimno je važna u sprječavanju prijenosa infekcija ovim bakterijama i ispravnog odabira antibiotika u njihovom liječenju.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA