Pregled bibliografske jedinice broj: 1096259
Učinak promijenjene ekspresije gena BPM na de novo metilaciju DNA uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)
Učinak promijenjene ekspresije gena BPM na de novo metilaciju DNA uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.), 2017., diplomski rad, diplomski, Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
CROSBI ID: 1096259 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Učinak promijenjene ekspresije gena BPM na de novo
metilaciju DNA uročnjaka (Arabidopsis thaliana L.)
(Effect of altered BPM gene expression on de novo
DNA methylation in Arabidopsis thaliana L.)
Autori
Mohorović, Petar
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski
Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet
Mjesto
Zagreb
Datum
30.01
Godina
2017
Stranica
72
Mentor
Bauer, Nataša
Ključne riječi
BPM ; ubikvitin-proteasomni put ; de novo DNA metilacija ; RdDM ; metilacijski ovisni restrikcijski enzimi
(BPM ; ubiquitin proteasome pathway ; de novo DNA methylation ; RdDM ; methylation dependant restriction enzymes)
Sažetak
Proteini BPM, kojima je dosada opisana uloga u degradaciji proteina putem ubikvitin proteasoma, ulaze u interakciju s proteinima koji su uključeni u de novo metilaciju DNA uročnjaka Arabidopsis thaliana. Nije poznato utječu li proteini BPM na metiliranost molekule DNA, a kako bi se provjerila potencijalna uloga proteina BPM u metilaciji DNA, koristile su se linije biljaka u kojima je promijenjena ekspresija gena BPM. Analizirala se metiliranost lokusa molekule DNA koji bi mogli biti pod utjecajem de novo metilacije. Analiza metiliranosti DNA provela se enzimatskom digestijom restrikcijskim enzimima koji su ovisni ili osjetljivi na metilaciju DNA, nakon koje je uslijedilo umnažanje istraživanih lokusa lančanom reakcijom polimerazom. Nakon gel elektroforeze i denzitometrijske obrade, te usporedbe rezultata dobivenih za nepocijepanu DNA i DNA pocijepanu metilacijski ovisnim enzimima MspJI i metilacijski osjetljivim enzimima HaeIII ili AluI, utvrdile su se promjene u metiliranosti u biljaka divljeg tipa kao i u biljaka koje različito eksprimiraju gene BPM. Rezultati pokazuju da promijenjene ekspresije gena BPM dovode do promjene u stupnju metiliranosti ponavljajućih sekvenci molekule DNA dok rezultati istraživanja promotorskih regija određenih gena ne daju jasnu sliku promjene obrasca metiliranosti te su potrebna dodatna istraživanja kako bi se to utvrdilo.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Biologija
