Naslov
Alternativno prekrajanje gena BPM1, BPM2 i BPM3 u uvjetima temperaturnog stresa
(Alternative splicing of BPM1, BPM2 and BPM3 genes under temperature stress conditions)

Autori
Pali, Dorotea

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
24.01

Godina
2020

Stranica
73

Mentor
Bauer, Nataša

Neposredni voditelj
Škiljaica, Andreja

Ključne riječi
alternativno izrezivanje ; ekspresija gena ; temperaturni stres ; Arabidopsis thaliana ; geni BPM
(alternative gene splicing ; gene expression ; temperature stress ; Arabidopsis thaliana ; BPM genes)

Sažetak
Članovi proteinske porodice MATH-BTB/POZ, koji sudjeluju u degradaciji proteina ovisnoj o ubikvitinu, utječu na odgovor biljke u stresnim uvjetima kroz interakciju s različitim transkripcijskim faktorima. Šest gena (BPM1-6) u uročnjaku (Arabidopsis thaliana L.) kodira za najmanje 16 različitih proteina BPM koji nastaju u procesu alternativnog prekrajanja gena. Novo istraživanje je pokazalo induciranu ekspresiju gena BPM1-3 te različiti intenzitet umnažanja varijanti gena BPM1 tijekom izlaganja biljke povišenoj temperaturi. U ovom radu je istražen učinak temperature na ekspresiju varijanti gena BPM1-3 pomoću lančane reakcije polimerazom. Osim toga nastojalo se ispitati postojanje novih ekspresijskih varijanti koje nastaju pod utjecajem temperaturnih varijacija. U tu svrhu dizajnirane su i optimizirane specifične početnice za umnažanje varijanti gena BPM1-3. Iz klijanaca uročnjaka izloženih različitim temperaturama izolirana je cDNA koja je korištena kao kalup u umnažanju, a fragmenti koji su se umnožili ugrađeni su u vektor pGEM®- T Easy tehnikom TA kloniranja. Kako bi se usporedila sličnost s postojećim varijantama gena BPM1-3, nova varijanta gena je sekvencirana. Potvrđeno je da su genska ekspresija i alternativno prekrajanje gena BPM1-3 inducirani temperaturom. Otkrivena je nova varijanta gena BPM2.6 koja se sintetizira u normalnim uvjetima rasta i u uvjetima povišene temperature. S obzirom na izostanak domene BTB/POZ koja je neophodna za interakciju s kulinom, otkriće ove varijante predstavlja osnovu za daljnja istraživanja u okviru uloga proteina BPM neovisnih o kulinu.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA