Pregled bibliografske jedinice broj: 1063620
Primjena Pythona u kemijskom modeliranju
Primjena Pythona u kemijskom modeliranju // XI. Susret mladih kemijskih inženjera : knjiga sažetaka = XI Meeting of Young Chemical Engineers : book of abstracts / Matijašić, Gordana (ur.).
Zagreb: Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2016. str. 53-53 (predavanje, domaća recenzija, sažetak, stručni)
CROSBI ID: 1063620 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca
Naslov
Primjena Pythona u kemijskom modeliranju
(Applying Python in chemical modelling)
Autori
Lovrić, Mario ; Lučić, Bono
Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, stručni
Izvornik
XI. Susret mladih kemijskih inženjera : knjiga sažetaka = XI Meeting of Young Chemical Engineers : book of abstracts
/ Matijašić, Gordana - Zagreb : Hrvatsko društvo kemijskih inženjera i tehnologa (HDKI), 2016, 53-53
ISBN
978-953-6894-55-0
Skup
XI. Susret mladih kemijskih inženjera (SMLKI) = XI Meeting of Young Chemical Engineers
Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 18.02.2016. - 19.02.2016
Vrsta sudjelovanja
Predavanje
Vrsta recenzije
Domaća recenzija
Ključne riječi
molekulsko modeliranje ; Python ; programiranje ; topljivost molekula, Python, programski jezik ; topljivost molekula ; modul scipy ; scikit ; SMILES ; RDkit
(molecular modeling ; Python ; programming language ; programming, solubility of molecules ; module scipy ; scikit ; SMILES ; RDkit)
Sažetak
Python je idealan programski jezik za učenje programiranja, a programi pisani u Pythonu kraći su i jednostavniji u usporedbi s ostalim programskim jezicima. Zbog brojnih biblioteka gotovih programskih cjelina koje se mogu po potrebi pozivati u programu i besplatnog koda postao je popularan u istraživanjima i razvoju u raznim područjima, pa tako i u kemiji i farmaciji. Postoje brojni primjeri uporabe programskoga jezika Python u računalnoj kemiji koje primjenjuju i pojedine farmaceutske kompanije. Na jednostavnom primjeru modeliranja topljivosti skupa organskih molekula u vodi prikazana je uporaba Pythona, te mogućnosti koje nudi taj programski jezik. Model se temelji na algoritmima izbora najbolje varijable (kao i rangiranja varijabli na temelju kvalitete korelacije s topljivošću molekula) iz Pythonovih modula scipy i scikit. Deskriptori su izračunati pomoću kemoinformatičkog modula RDkit polazeći od strukture molekule u obliku SMILES koja se konvertira u MOL oblik.
Izvorni jezik
Hrvatski
Znanstvena područja
Kemija, Kemijsko inženjerstvo
POVEZANOST RADA
Projekti:
Basic grant of MZO/RBI to Bono Lučić
Ustanove:
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb,
PLIVA HRVATSKA d.o.o.