Naslov
Konstrukcija TALEN-a za inaktivaciju gena HNF1A u stanicama HepG2
(TALEN construction for knockout of HNF1A gene in HepG2 cells)

Autori
Tremski, Mihaela

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, diplomski rad, diplomski

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
25.02

Godina
2016

Stranica
64

Mentor
Vojta, Aleksandar

Neposredni voditelj
Markulin, Dora

Ključne riječi
genomsko inženjerstvo ; TALEN ; inaktivacija gena ; HNF1A ; HepG2 stanična linija ; transfekcija
(genomic engineering ; TALEN ; knock out ; HNF1A gene ; HepG2 cell line ; transfection)

Sažetak
Tehnologija genomskog inženjerstva omogućava specifičnu i efikasnu modifikaciju u genomu domaćina za razliku od prijašnjih metoda mutageneze pomoću rekombinaza, virusnih integraza i transpozaza. Kimerna nukleaza TALEN je fuzija proteina TALE i FokI nukleaze. TALEN vezujućom domenom specifično prepoznaje ciljnu sekvencu DNA, a nukleazna domena uvodi dvolančani lom. Popravak ovakvih lomova NHEJ mehanizmom često rezultira malim delecijama ili insercijama koje dovode do pomaka u okviru čitanja te inaktivacije ciljanog gena. Cilj ovog rada bio je konstrukcija TALEN-a za ciljno mjesto u genu HNF1A i transfekcija u HepG2 stanice. TALEN-i su uspješno konstruirani metodom Golden Gate kloniranja i transfecirani u HepG2 stanice. Detekcijom fluorescencije proteina EGFP utvrđena je umjerena efikasnost transfekcije. Proveden je T7E1 test koji nije dovoljno osjetljiv za detekciju mutanata u HepG2 stanicama potvrđene efikasnosti transfekcije. Za dobivanje stabilne stanične linije s inaktiviranim genom HNF1A treba provesti selekciju na linijama dobivenim uzgojem od pojedinačnih stanica. Stanična linija s inaktiviranim HNF1A bila bi izvrstan model za istraživanja funkcije gena HNF1A.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija

POVEZANOST RADA